Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zfp397Q7TNK4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zfp397Q7TNK4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zfp397Q7TNK4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zfp397Q7TNK4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zfp397Q7TNK4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zfp397Q7TNK4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zfp397Q7TNK4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zfp397Q7TNK4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp397Q7TNK4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp397Q7TNK4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfp397Q7TNK4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp397Q7TNK4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp397Q7TNK4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp397Q7TNK4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp397Q7TNK4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp397Q7TNK4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp397Q7TNK4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp397Q7TNK4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp397Q7TNK4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfp397Q7TNK4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zfp397Q7TNK4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zfp397Q7TNK4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zfp397Q7TNK4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zfp397Q7TNK4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zfp397Q7TNK4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zfp397Q7TNK4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zfp397Q7TNK4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp397Q7TNK4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp397Q7TNK4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp397Q7TNK4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp397Q7TNK4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp397Q7TNK4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfp397Q7TNK4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Zfp397Q7TNK4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zfp397Q7TNK4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zfp397Q7TNK4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zfp397Q7TNK4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zfp397Q7TNK4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zfp397Q7TNK4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zfp397Q7TNK4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zfp397Q7TNK4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zfp397Q7TNK4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zfp397Q7TNK4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zfp397Q7TNK4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zfp397Q7TNK4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zfp397Q7TNK4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zfp397Q7TNK4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zfp397Q7TNK4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Zfp397Q7TNK4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zfp397Q7TNK4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zfp397Q7TNK4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zfp397Q7TNK4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zfp397Q7TNK4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zfp397Q7TNK4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zfp397Q7TNK4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zfp397Q7TNK4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zfp397Q7TNK4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zfp397Q7TNK4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zfp397Q7TNK4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zfp397Q7TNK4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Zfp397Q7TNK4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zfp397Q7TNK4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zfp397Q7TNK4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zfp397Q7TNK4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zfp397Q7TNK4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zfp397Q7TNK4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zfp397Q7TNK4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zfp397Q7TNK4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zfp397Q7TNK4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zfp397Q7TNK4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zfp397Q7TNK4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Zfp397Q7TNK4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zfp397Q7TNK4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zfp397Q7TNK4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zfp397Q7TNK4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zfp397Q7TNK4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Zfp397Q7TNK4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zfp397Q7TNK4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zfp397Q7TNK4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zfp397Q7TNK4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zfp397Q7TNK4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zfp397Q7TNK4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zfp397Q7TNK4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zfp397Q7TNK4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zfp397Q7TNK4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zfp397Q7TNK4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zfp397Q7TNK4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zfp397Q7TNK4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zfp397Q7TNK4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zfp397Q7TNK4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zfp397Q7TNK4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zfp397Q7TNK4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zfp397Q7TNK4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zfp397Q7TNK4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zfp397Q7TNK4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zfp397Q7TNK4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zfp397Q7TNK4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zfp397Q7TNK4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zfp397Q7TNK4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms