Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HhipQ7TN16 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HhipQ7TN16 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HhipQ7TN16 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HhipQ7TN16 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HhipQ7TN16 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HhipQ7TN16 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HhipQ7TN16 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HhipQ7TN16 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HhipQ7TN16 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HhipQ7TN16 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HhipQ7TN16 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HhipQ7TN16 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HhipQ7TN16 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HhipQ7TN16 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HhipQ7TN16 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HhipQ7TN16 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HhipQ7TN16 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HhipQ7TN16 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HhipQ7TN16 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HhipQ7TN16 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HhipQ7TN16 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HhipQ7TN16 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HhipQ7TN16 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HhipQ7TN16 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HhipQ7TN16 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HhipQ7TN16 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HhipQ7TN16 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HhipQ7TN16 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HhipQ7TN16 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HhipQ7TN16 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HhipQ7TN16 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HhipQ7TN16 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HhipQ7TN16 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HhipQ7TN16 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HhipQ7TN16 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HhipQ7TN16 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HhipQ7TN16 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HhipQ7TN16 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HhipQ7TN16 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HhipQ7TN16 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HhipQ7TN16 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HhipQ7TN16 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HhipQ7TN16 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HhipQ7TN16 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HhipQ7TN16 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HhipQ7TN16 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HhipQ7TN16 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HhipQ7TN16 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HhipQ7TN16 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HhipQ7TN16 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HhipQ7TN16 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HhipQ7TN16 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HhipQ7TN16 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HhipQ7TN16 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HhipQ7TN16 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HhipQ7TN16 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HhipQ7TN16 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HhipQ7TN16 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HhipQ7TN16 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HhipQ7TN16 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HhipQ7TN16 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HhipQ7TN16 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HhipQ7TN16 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HhipQ7TN16 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HhipQ7TN16 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HhipQ7TN16 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HhipQ7TN16 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HhipQ7TN16 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HhipQ7TN16 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HhipQ7TN16 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HhipQ7TN16 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HhipQ7TN16 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HhipQ7TN16 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HhipQ7TN16 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HhipQ7TN16 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HhipQ7TN16 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HhipQ7TN16 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HhipQ7TN16 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HhipQ7TN16 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HhipQ7TN16 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HhipQ7TN16 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HhipQ7TN16 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HhipQ7TN16 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HhipQ7TN16 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HhipQ7TN16 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HhipQ7TN16 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HhipQ7TN16 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HhipQ7TN16 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HhipQ7TN16 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HhipQ7TN16 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HhipQ7TN16 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HhipQ7TN16 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HhipQ7TN16 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HhipQ7TN16 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HhipQ7TN16 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HhipQ7TN16 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HhipQ7TN16 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HhipQ7TN16 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HhipQ7TN16 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms