Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU3

Mvb12a, Multivesicular body subunit 12A, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12aQ78HU3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Mvb12aQ78HU3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mvb12aQ78HU3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mvb12aQ78HU3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mvb12aQ78HU3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mvb12aQ78HU3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mvb12aQ78HU3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mvb12aQ78HU3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mvb12aQ78HU3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mvb12aQ78HU3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mvb12aQ78HU3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mvb12aQ78HU3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mvb12aQ78HU3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mvb12aQ78HU3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mvb12aQ78HU3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mvb12aQ78HU3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mvb12aQ78HU3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Mvb12aQ78HU3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mvb12aQ78HU3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mvb12aQ78HU3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mvb12aQ78HU3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mvb12aQ78HU3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Mvb12aQ78HU3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mvb12aQ78HU3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Mvb12aQ78HU3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mvb12aQ78HU3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mvb12aQ78HU3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mvb12aQ78HU3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mvb12aQ78HU3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Mvb12aQ78HU3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mvb12aQ78HU3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mvb12aQ78HU3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mvb12aQ78HU3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mvb12aQ78HU3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mvb12aQ78HU3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mvb12aQ78HU3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mvb12aQ78HU3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mvb12aQ78HU3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Mvb12aQ78HU3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mvb12aQ78HU3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mvb12aQ78HU3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mvb12aQ78HU3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mvb12aQ78HU3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mvb12aQ78HU3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mvb12aQ78HU3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mvb12aQ78HU3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mvb12aQ78HU3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mvb12aQ78HU3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Mvb12aQ78HU3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mvb12aQ78HU3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mvb12aQ78HU3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mvb12aQ78HU3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mvb12aQ78HU3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mvb12aQ78HU3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mvb12aQ78HU3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mvb12aQ78HU3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mvb12aQ78HU3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mvb12aQ78HU3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mvb12aQ78HU3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mvb12aQ78HU3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mvb12aQ78HU3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mvb12aQ78HU3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mvb12aQ78HU3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mvb12aQ78HU3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mvb12aQ78HU3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mvb12aQ78HU3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mvb12aQ78HU3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mvb12aQ78HU3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mvb12aQ78HU3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mvb12aQ78HU3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mvb12aQ78HU3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mvb12aQ78HU3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Mvb12aQ78HU3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mvb12aQ78HU3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mvb12aQ78HU3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mvb12aQ78HU3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mvb12aQ78HU3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mvb12aQ78HU3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Mvb12aQ78HU3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mvb12aQ78HU3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mvb12aQ78HU3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mvb12aQ78HU3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Mvb12aQ78HU3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mvb12aQ78HU3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mvb12aQ78HU3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mvb12aQ78HU3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mvb12aQ78HU3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mvb12aQ78HU3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mvb12aQ78HU3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mvb12aQ78HU3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mvb12aQ78HU3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mvb12aQ78HU3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mvb12aQ78HU3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mvb12aQ78HU3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mvb12aQ78HU3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mvb12aQ78HU3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mvb12aQ78HU3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mvb12aQ78HU3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mvb12aQ78HU3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mvb12aQ78HU3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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