Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trpv1Q704Y3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trpv1Q704Y3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trpv1Q704Y3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Trpv1Q704Y3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trpv1Q704Y3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trpv1Q704Y3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Trpv1Q704Y3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trpv1Q704Y3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Trpv1Q704Y3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trpv1Q704Y3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trpv1Q704Y3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trpv1Q704Y3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trpv1Q704Y3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trpv1Q704Y3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trpv1Q704Y3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trpv1Q704Y3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Trpv1Q704Y3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trpv1Q704Y3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trpv1Q704Y3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trpv1Q704Y3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trpv1Q704Y3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trpv1Q704Y3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trpv1Q704Y3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trpv1Q704Y3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Trpv1Q704Y3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trpv1Q704Y3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trpv1Q704Y3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trpv1Q704Y3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpv1Q704Y3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpv1Q704Y3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpv1Q704Y3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpv1Q704Y3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trpv1Q704Y3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trpv1Q704Y3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Trpv1Q704Y3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trpv1Q704Y3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trpv1Q704Y3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trpv1Q704Y3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trpv1Q704Y3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trpv1Q704Y3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trpv1Q704Y3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trpv1Q704Y3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trpv1Q704Y3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Trpv1Q704Y3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trpv1Q704Y3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpv1Q704Y3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpv1Q704Y3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpv1Q704Y3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpv1Q704Y3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpv1Q704Y3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpv1Q704Y3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trpv1Q704Y3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trpv1Q704Y3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trpv1Q704Y3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trpv1Q704Y3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trpv1Q704Y3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trpv1Q704Y3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trpv1Q704Y3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Trpv1Q704Y3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trpv1Q704Y3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trpv1Q704Y3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trpv1Q704Y3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trpv1Q704Y3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trpv1Q704Y3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpv1Q704Y3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpv1Q704Y3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpv1Q704Y3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpv1Q704Y3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpv1Q704Y3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpv1Q704Y3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpv1Q704Y3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpv1Q704Y3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trpv1Q704Y3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trpv1Q704Y3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trpv1Q704Y3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trpv1Q704Y3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trpv1Q704Y3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trpv1Q704Y3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trpv1Q704Y3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trpv1Q704Y3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trpv1Q704Y3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trpv1Q704Y3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trpv1Q704Y3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trpv1Q704Y3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trpv1Q704Y3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trpv1Q704Y3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trpv1Q704Y3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trpv1Q704Y3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Trpv1Q704Y3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trpv1Q704Y3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trpv1Q704Y3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trpv1Q704Y3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Trpv1Q704Y3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trpv1Q704Y3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Trpv1Q704Y3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trpv1Q704Y3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trpv1Q704Y3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trpv1Q704Y3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trpv1Q704Y3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 256.4 ms