Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Topbp1Q6ZQF0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Topbp1Q6ZQF0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Topbp1Q6ZQF0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Topbp1Q6ZQF0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Topbp1Q6ZQF0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Topbp1Q6ZQF0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Topbp1Q6ZQF0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Topbp1Q6ZQF0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Topbp1Q6ZQF0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Topbp1Q6ZQF0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Topbp1Q6ZQF0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Topbp1Q6ZQF0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Topbp1Q6ZQF0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Topbp1Q6ZQF0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Topbp1Q6ZQF0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Topbp1Q6ZQF0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Topbp1Q6ZQF0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Topbp1Q6ZQF0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Topbp1Q6ZQF0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Topbp1Q6ZQF0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Topbp1Q6ZQF0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Topbp1Q6ZQF0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Topbp1Q6ZQF0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Topbp1Q6ZQF0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Topbp1Q6ZQF0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Topbp1Q6ZQF0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Topbp1Q6ZQF0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Topbp1Q6ZQF0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Topbp1Q6ZQF0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Topbp1Q6ZQF0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Topbp1Q6ZQF0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Topbp1Q6ZQF0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Topbp1Q6ZQF0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Topbp1Q6ZQF0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Topbp1Q6ZQF0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Topbp1Q6ZQF0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Topbp1Q6ZQF0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Topbp1Q6ZQF0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Topbp1Q6ZQF0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Topbp1Q6ZQF0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Topbp1Q6ZQF0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Topbp1Q6ZQF0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Topbp1Q6ZQF0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Topbp1Q6ZQF0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Topbp1Q6ZQF0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Topbp1Q6ZQF0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
Topbp1Q6ZQF0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Topbp1Q6ZQF0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Topbp1Q6ZQF0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Topbp1Q6ZQF0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Topbp1Q6ZQF0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Topbp1Q6ZQF0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Topbp1Q6ZQF0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Topbp1Q6ZQF0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Topbp1Q6ZQF0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Topbp1Q6ZQF0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Topbp1Q6ZQF0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Topbp1Q6ZQF0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Topbp1Q6ZQF0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC33.76■■■■□ 3
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
Topbp1Q6ZQF0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Topbp1Q6ZQF0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Topbp1Q6ZQF0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Topbp1Q6ZQF0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Topbp1Q6ZQF0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Topbp1Q6ZQF0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Topbp1Q6ZQF0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Topbp1Q6ZQF0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Topbp1Q6ZQF0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Topbp1Q6ZQF0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Topbp1Q6ZQF0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Topbp1Q6ZQF0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Topbp1Q6ZQF0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Topbp1Q6ZQF0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Topbp1Q6ZQF0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Topbp1Q6ZQF0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Topbp1Q6ZQF0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Topbp1Q6ZQF0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Topbp1Q6ZQF0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Topbp1Q6ZQF0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Topbp1Q6ZQF0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Topbp1Q6ZQF0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Topbp1Q6ZQF0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Topbp1Q6ZQF0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Topbp1Q6ZQF0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Topbp1Q6ZQF0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Topbp1Q6ZQF0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Topbp1Q6ZQF0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Topbp1Q6ZQF0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Topbp1Q6ZQF0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Topbp1Q6ZQF0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Topbp1Q6ZQF0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Topbp1Q6ZQF0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Topbp1Q6ZQF0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Topbp1Q6ZQF0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Topbp1Q6ZQF0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Topbp1Q6ZQF0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms