Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot1Q6ZQ08 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot1Q6ZQ08 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot1Q6ZQ08 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot1Q6ZQ08 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot1Q6ZQ08 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnot1Q6ZQ08 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot1Q6ZQ08 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot1Q6ZQ08 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot1Q6ZQ08 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot1Q6ZQ08 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnot1Q6ZQ08 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot1Q6ZQ08 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot1Q6ZQ08 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot1Q6ZQ08 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot1Q6ZQ08 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot1Q6ZQ08 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot1Q6ZQ08 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnot1Q6ZQ08 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot1Q6ZQ08 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot1Q6ZQ08 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot1Q6ZQ08 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot1Q6ZQ08 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnot1Q6ZQ08 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnot1Q6ZQ08 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnot1Q6ZQ08 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot1Q6ZQ08 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot1Q6ZQ08 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot1Q6ZQ08 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot1Q6ZQ08 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot1Q6ZQ08 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot1Q6ZQ08 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot1Q6ZQ08 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot1Q6ZQ08 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot1Q6ZQ08 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot1Q6ZQ08 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot1Q6ZQ08 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot1Q6ZQ08 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot1Q6ZQ08 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot1Q6ZQ08 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot1Q6ZQ08 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot1Q6ZQ08 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnot1Q6ZQ08 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot1Q6ZQ08 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot1Q6ZQ08 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot1Q6ZQ08 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot1Q6ZQ08 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot1Q6ZQ08 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot1Q6ZQ08 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot1Q6ZQ08 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnot1Q6ZQ08 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnot1Q6ZQ08 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot1Q6ZQ08 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot1Q6ZQ08 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnot1Q6ZQ08 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnot1Q6ZQ08 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnot1Q6ZQ08 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnot1Q6ZQ08 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot1Q6ZQ08 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot1Q6ZQ08 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot1Q6ZQ08 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot1Q6ZQ08 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot1Q6ZQ08 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot1Q6ZQ08 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot1Q6ZQ08 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot1Q6ZQ08 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot1Q6ZQ08 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot1Q6ZQ08 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot1Q6ZQ08 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cnot1Q6ZQ08 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cnot1Q6ZQ08 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cnot1Q6ZQ08 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cnot1Q6ZQ08 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot1Q6ZQ08 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot1Q6ZQ08 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot1Q6ZQ08 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot1Q6ZQ08 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot1Q6ZQ08 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot1Q6ZQ08 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot1Q6ZQ08 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot1Q6ZQ08 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot1Q6ZQ08 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot1Q6ZQ08 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot1Q6ZQ08 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot1Q6ZQ08 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot1Q6ZQ08 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot1Q6ZQ08 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot1Q6ZQ08 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot1Q6ZQ08 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnot1Q6ZQ08 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnot1Q6ZQ08 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms