Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pcp4l1Q6W8Q3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pcp4l1Q6W8Q3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pcp4l1Q6W8Q3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pcp4l1Q6W8Q3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pcp4l1Q6W8Q3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pcp4l1Q6W8Q3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pcp4l1Q6W8Q3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pcp4l1Q6W8Q3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pcp4l1Q6W8Q3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pcp4l1Q6W8Q3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pcp4l1Q6W8Q3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pcp4l1Q6W8Q3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pcp4l1Q6W8Q3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pcp4l1Q6W8Q3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pcp4l1Q6W8Q3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pcp4l1Q6W8Q3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pcp4l1Q6W8Q3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pcp4l1Q6W8Q3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pcp4l1Q6W8Q3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcp4l1Q6W8Q3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcp4l1Q6W8Q3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcp4l1Q6W8Q3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcp4l1Q6W8Q3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcp4l1Q6W8Q3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcp4l1Q6W8Q3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcp4l1Q6W8Q3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcp4l1Q6W8Q3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcp4l1Q6W8Q3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcp4l1Q6W8Q3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcp4l1Q6W8Q3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcp4l1Q6W8Q3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcp4l1Q6W8Q3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcp4l1Q6W8Q3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pcp4l1Q6W8Q3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcp4l1Q6W8Q3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcp4l1Q6W8Q3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcp4l1Q6W8Q3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcp4l1Q6W8Q3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcp4l1Q6W8Q3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcp4l1Q6W8Q3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcp4l1Q6W8Q3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pcp4l1Q6W8Q3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pcp4l1Q6W8Q3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pcp4l1Q6W8Q3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pcp4l1Q6W8Q3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pcp4l1Q6W8Q3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pcp4l1Q6W8Q3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pcp4l1Q6W8Q3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pcp4l1Q6W8Q3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pcp4l1Q6W8Q3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pcp4l1Q6W8Q3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pcp4l1Q6W8Q3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pcp4l1Q6W8Q3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pcp4l1Q6W8Q3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pcp4l1Q6W8Q3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pcp4l1Q6W8Q3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pcp4l1Q6W8Q3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pcp4l1Q6W8Q3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Pcp4l1Q6W8Q3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pcp4l1Q6W8Q3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pcp4l1Q6W8Q3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pcp4l1Q6W8Q3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pcp4l1Q6W8Q3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pcp4l1Q6W8Q3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pcp4l1Q6W8Q3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pcp4l1Q6W8Q3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pcp4l1Q6W8Q3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pcp4l1Q6W8Q3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pcp4l1Q6W8Q3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcp4l1Q6W8Q3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcp4l1Q6W8Q3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcp4l1Q6W8Q3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcp4l1Q6W8Q3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcp4l1Q6W8Q3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcp4l1Q6W8Q3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcp4l1Q6W8Q3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcp4l1Q6W8Q3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcp4l1Q6W8Q3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcp4l1Q6W8Q3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcp4l1Q6W8Q3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pcp4l1Q6W8Q3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcp4l1Q6W8Q3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcp4l1Q6W8Q3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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