Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY53

AY358078, HN1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY358078Q6UY53 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AY358078Q6UY53 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AY358078Q6UY53 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AY358078Q6UY53 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AY358078Q6UY53 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AY358078Q6UY53 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AY358078Q6UY53 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AY358078Q6UY53 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AY358078Q6UY53 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AY358078Q6UY53 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AY358078Q6UY53 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AY358078Q6UY53 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AY358078Q6UY53 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AY358078Q6UY53 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AY358078Q6UY53 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AY358078Q6UY53 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AY358078Q6UY53 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AY358078Q6UY53 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AY358078Q6UY53 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AY358078Q6UY53 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AY358078Q6UY53 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AY358078Q6UY53 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AY358078Q6UY53 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AY358078Q6UY53 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AY358078Q6UY53 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AY358078Q6UY53 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AY358078Q6UY53 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AY358078Q6UY53 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AY358078Q6UY53 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AY358078Q6UY53 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AY358078Q6UY53 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AY358078Q6UY53 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AY358078Q6UY53 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AY358078Q6UY53 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AY358078Q6UY53 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AY358078Q6UY53 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
AY358078Q6UY53 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AY358078Q6UY53 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AY358078Q6UY53 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AY358078Q6UY53 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AY358078Q6UY53 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AY358078Q6UY53 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AY358078Q6UY53 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AY358078Q6UY53 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AY358078Q6UY53 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AY358078Q6UY53 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AY358078Q6UY53 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AY358078Q6UY53 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AY358078Q6UY53 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AY358078Q6UY53 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AY358078Q6UY53 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AY358078Q6UY53 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AY358078Q6UY53 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AY358078Q6UY53 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AY358078Q6UY53 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AY358078Q6UY53 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AY358078Q6UY53 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AY358078Q6UY53 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AY358078Q6UY53 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AY358078Q6UY53 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AY358078Q6UY53 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AY358078Q6UY53 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AY358078Q6UY53 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AY358078Q6UY53 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AY358078Q6UY53 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AY358078Q6UY53 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AY358078Q6UY53 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AY358078Q6UY53 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AY358078Q6UY53 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AY358078Q6UY53 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AY358078Q6UY53 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AY358078Q6UY53 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AY358078Q6UY53 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AY358078Q6UY53 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AY358078Q6UY53 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AY358078Q6UY53 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AY358078Q6UY53 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AY358078Q6UY53 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AY358078Q6UY53 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AY358078Q6UY53 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AY358078Q6UY53 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AY358078Q6UY53 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AY358078Q6UY53 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AY358078Q6UY53 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AY358078Q6UY53 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AY358078Q6UY53 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AY358078Q6UY53 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
AY358078Q6UY53 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AY358078Q6UY53 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AY358078Q6UY53 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AY358078Q6UY53 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AY358078Q6UY53 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AY358078Q6UY53 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
AY358078Q6UY53 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AY358078Q6UY53 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AY358078Q6UY53 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AY358078Q6UY53 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AY358078Q6UY53 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AY358078Q6UY53 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AY358078Q6UY53 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms