Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gja6Q6S5G4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gja6Q6S5G4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gja6Q6S5G4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Gja6Q6S5G4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gja6Q6S5G4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gja6Q6S5G4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gja6Q6S5G4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gja6Q6S5G4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gja6Q6S5G4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gja6Q6S5G4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gja6Q6S5G4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gja6Q6S5G4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gja6Q6S5G4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gja6Q6S5G4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gja6Q6S5G4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gja6Q6S5G4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gja6Q6S5G4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gja6Q6S5G4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gja6Q6S5G4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gja6Q6S5G4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Gja6Q6S5G4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gja6Q6S5G4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gja6Q6S5G4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gja6Q6S5G4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gja6Q6S5G4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gja6Q6S5G4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gja6Q6S5G4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Gja6Q6S5G4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gja6Q6S5G4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gja6Q6S5G4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gja6Q6S5G4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gja6Q6S5G4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gja6Q6S5G4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gja6Q6S5G4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gja6Q6S5G4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gja6Q6S5G4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Gja6Q6S5G4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gja6Q6S5G4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gja6Q6S5G4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gja6Q6S5G4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gja6Q6S5G4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gja6Q6S5G4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gja6Q6S5G4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gja6Q6S5G4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gja6Q6S5G4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gja6Q6S5G4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gja6Q6S5G4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gja6Q6S5G4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gja6Q6S5G4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gja6Q6S5G4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gja6Q6S5G4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gja6Q6S5G4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gja6Q6S5G4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gja6Q6S5G4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gja6Q6S5G4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gja6Q6S5G4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gja6Q6S5G4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gja6Q6S5G4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gja6Q6S5G4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gja6Q6S5G4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gja6Q6S5G4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gja6Q6S5G4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gja6Q6S5G4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Gja6Q6S5G4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gja6Q6S5G4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gja6Q6S5G4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gja6Q6S5G4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gja6Q6S5G4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gja6Q6S5G4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gja6Q6S5G4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gja6Q6S5G4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gja6Q6S5G4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gja6Q6S5G4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gja6Q6S5G4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gja6Q6S5G4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gja6Q6S5G4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gja6Q6S5G4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gja6Q6S5G4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gja6Q6S5G4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gja6Q6S5G4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gja6Q6S5G4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Gja6Q6S5G4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gja6Q6S5G4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gja6Q6S5G4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gja6Q6S5G4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gja6Q6S5G4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gja6Q6S5G4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gja6Q6S5G4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gja6Q6S5G4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gja6Q6S5G4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gja6Q6S5G4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gja6Q6S5G4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gja6Q6S5G4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gja6Q6S5G4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gja6Q6S5G4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gja6Q6S5G4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gja6Q6S5G4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gja6Q6S5G4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gja6Q6S5G4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms