Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnip4Q6PHZ8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnip4Q6PHZ8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnip4Q6PHZ8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnip4Q6PHZ8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnip4Q6PHZ8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnip4Q6PHZ8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnip4Q6PHZ8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnip4Q6PHZ8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnip4Q6PHZ8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnip4Q6PHZ8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnip4Q6PHZ8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnip4Q6PHZ8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnip4Q6PHZ8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnip4Q6PHZ8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnip4Q6PHZ8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnip4Q6PHZ8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnip4Q6PHZ8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnip4Q6PHZ8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnip4Q6PHZ8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnip4Q6PHZ8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnip4Q6PHZ8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnip4Q6PHZ8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnip4Q6PHZ8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnip4Q6PHZ8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnip4Q6PHZ8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnip4Q6PHZ8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnip4Q6PHZ8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Kcnip4Q6PHZ8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnip4Q6PHZ8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnip4Q6PHZ8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnip4Q6PHZ8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnip4Q6PHZ8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnip4Q6PHZ8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnip4Q6PHZ8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnip4Q6PHZ8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnip4Q6PHZ8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnip4Q6PHZ8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnip4Q6PHZ8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnip4Q6PHZ8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnip4Q6PHZ8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnip4Q6PHZ8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnip4Q6PHZ8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnip4Q6PHZ8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnip4Q6PHZ8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnip4Q6PHZ8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnip4Q6PHZ8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnip4Q6PHZ8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnip4Q6PHZ8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnip4Q6PHZ8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnip4Q6PHZ8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnip4Q6PHZ8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnip4Q6PHZ8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnip4Q6PHZ8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnip4Q6PHZ8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnip4Q6PHZ8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms