Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS9

Cacna2d2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d2Q6PHS9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna2d2Q6PHS9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna2d2Q6PHS9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacna2d2Q6PHS9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacna2d2Q6PHS9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna2d2Q6PHS9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna2d2Q6PHS9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna2d2Q6PHS9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna2d2Q6PHS9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna2d2Q6PHS9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna2d2Q6PHS9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna2d2Q6PHS9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna2d2Q6PHS9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna2d2Q6PHS9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna2d2Q6PHS9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacna2d2Q6PHS9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacna2d2Q6PHS9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacna2d2Q6PHS9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacna2d2Q6PHS9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacna2d2Q6PHS9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacna2d2Q6PHS9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacna2d2Q6PHS9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna2d2Q6PHS9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna2d2Q6PHS9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna2d2Q6PHS9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna2d2Q6PHS9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna2d2Q6PHS9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna2d2Q6PHS9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna2d2Q6PHS9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna2d2Q6PHS9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna2d2Q6PHS9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna2d2Q6PHS9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna2d2Q6PHS9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna2d2Q6PHS9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna2d2Q6PHS9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna2d2Q6PHS9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna2d2Q6PHS9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna2d2Q6PHS9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna2d2Q6PHS9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna2d2Q6PHS9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna2d2Q6PHS9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna2d2Q6PHS9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna2d2Q6PHS9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacna2d2Q6PHS9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacna2d2Q6PHS9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacna2d2Q6PHS9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna2d2Q6PHS9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna2d2Q6PHS9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna2d2Q6PHS9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacna2d2Q6PHS9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacna2d2Q6PHS9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacna2d2Q6PHS9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacna2d2Q6PHS9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna2d2Q6PHS9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna2d2Q6PHS9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacna2d2Q6PHS9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna2d2Q6PHS9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna2d2Q6PHS9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna2d2Q6PHS9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna2d2Q6PHS9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacna2d2Q6PHS9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacna2d2Q6PHS9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacna2d2Q6PHS9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cacna2d2Q6PHS9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna2d2Q6PHS9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna2d2Q6PHS9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna2d2Q6PHS9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna2d2Q6PHS9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna2d2Q6PHS9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacna2d2Q6PHS9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacna2d2Q6PHS9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacna2d2Q6PHS9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacna2d2Q6PHS9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacna2d2Q6PHS9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna2d2Q6PHS9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna2d2Q6PHS9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna2d2Q6PHS9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna2d2Q6PHS9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacna2d2Q6PHS9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacna2d2Q6PHS9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacna2d2Q6PHS9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacna2d2Q6PHS9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacna2d2Q6PHS9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacna2d2Q6PHS9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacna2d2Q6PHS9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna2d2Q6PHS9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna2d2Q6PHS9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna2d2Q6PHS9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna2d2Q6PHS9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna2d2Q6PHS9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna2d2Q6PHS9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna2d2Q6PHS9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna2d2Q6PHS9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacna2d2Q6PHS9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cacna2d2Q6PHS9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cacna2d2Q6PHS9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacna2d2Q6PHS9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna2d2Q6PHS9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms