Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHQ9

Pabpc4, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4Q6PHQ9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pabpc4Q6PHQ9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pabpc4Q6PHQ9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pabpc4Q6PHQ9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pabpc4Q6PHQ9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Pabpc4Q6PHQ9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pabpc4Q6PHQ9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pabpc4Q6PHQ9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pabpc4Q6PHQ9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pabpc4Q6PHQ9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pabpc4Q6PHQ9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pabpc4Q6PHQ9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pabpc4Q6PHQ9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pabpc4Q6PHQ9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pabpc4Q6PHQ9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pabpc4Q6PHQ9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pabpc4Q6PHQ9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pabpc4Q6PHQ9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pabpc4Q6PHQ9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pabpc4Q6PHQ9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pabpc4Q6PHQ9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pabpc4Q6PHQ9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pabpc4Q6PHQ9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pabpc4Q6PHQ9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pabpc4Q6PHQ9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pabpc4Q6PHQ9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pabpc4Q6PHQ9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pabpc4Q6PHQ9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pabpc4Q6PHQ9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pabpc4Q6PHQ9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pabpc4Q6PHQ9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pabpc4Q6PHQ9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pabpc4Q6PHQ9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pabpc4Q6PHQ9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pabpc4Q6PHQ9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pabpc4Q6PHQ9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pabpc4Q6PHQ9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pabpc4Q6PHQ9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pabpc4Q6PHQ9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pabpc4Q6PHQ9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pabpc4Q6PHQ9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pabpc4Q6PHQ9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pabpc4Q6PHQ9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pabpc4Q6PHQ9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pabpc4Q6PHQ9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pabpc4Q6PHQ9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pabpc4Q6PHQ9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pabpc4Q6PHQ9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pabpc4Q6PHQ9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pabpc4Q6PHQ9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Pabpc4Q6PHQ9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pabpc4Q6PHQ9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pabpc4Q6PHQ9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pabpc4Q6PHQ9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pabpc4Q6PHQ9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pabpc4Q6PHQ9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pabpc4Q6PHQ9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pabpc4Q6PHQ9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pabpc4Q6PHQ9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pabpc4Q6PHQ9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pabpc4Q6PHQ9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pabpc4Q6PHQ9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pabpc4Q6PHQ9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pabpc4Q6PHQ9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pabpc4Q6PHQ9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pabpc4Q6PHQ9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pabpc4Q6PHQ9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pabpc4Q6PHQ9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pabpc4Q6PHQ9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pabpc4Q6PHQ9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pabpc4Q6PHQ9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pabpc4Q6PHQ9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pabpc4Q6PHQ9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pabpc4Q6PHQ9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pabpc4Q6PHQ9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pabpc4Q6PHQ9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pabpc4Q6PHQ9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pabpc4Q6PHQ9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pabpc4Q6PHQ9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pabpc4Q6PHQ9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pabpc4Q6PHQ9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pabpc4Q6PHQ9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pabpc4Q6PHQ9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pabpc4Q6PHQ9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pabpc4Q6PHQ9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Pabpc4Q6PHQ9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pabpc4Q6PHQ9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pabpc4Q6PHQ9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pabpc4Q6PHQ9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pabpc4Q6PHQ9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pabpc4Q6PHQ9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pabpc4Q6PHQ9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pabpc4Q6PHQ9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pabpc4Q6PHQ9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pabpc4Q6PHQ9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pabpc4Q6PHQ9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pabpc4Q6PHQ9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pabpc4Q6PHQ9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pabpc4Q6PHQ9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms