Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGN3

Dclk2, Serine/threonine-protein kinase DCLK2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk2Q6PGN3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dclk2Q6PGN3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dclk2Q6PGN3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Dclk2Q6PGN3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dclk2Q6PGN3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dclk2Q6PGN3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dclk2Q6PGN3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dclk2Q6PGN3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dclk2Q6PGN3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dclk2Q6PGN3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dclk2Q6PGN3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dclk2Q6PGN3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dclk2Q6PGN3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dclk2Q6PGN3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dclk2Q6PGN3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dclk2Q6PGN3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Dclk2Q6PGN3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Dclk2Q6PGN3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dclk2Q6PGN3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dclk2Q6PGN3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dclk2Q6PGN3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dclk2Q6PGN3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dclk2Q6PGN3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dclk2Q6PGN3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dclk2Q6PGN3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dclk2Q6PGN3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dclk2Q6PGN3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dclk2Q6PGN3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Dclk2Q6PGN3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dclk2Q6PGN3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dclk2Q6PGN3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Dclk2Q6PGN3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Dclk2Q6PGN3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dclk2Q6PGN3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dclk2Q6PGN3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Dclk2Q6PGN3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dclk2Q6PGN3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dclk2Q6PGN3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dclk2Q6PGN3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dclk2Q6PGN3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Dclk2Q6PGN3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dclk2Q6PGN3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dclk2Q6PGN3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dclk2Q6PGN3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dclk2Q6PGN3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dclk2Q6PGN3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dclk2Q6PGN3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dclk2Q6PGN3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dclk2Q6PGN3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dclk2Q6PGN3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dclk2Q6PGN3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dclk2Q6PGN3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dclk2Q6PGN3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dclk2Q6PGN3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dclk2Q6PGN3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dclk2Q6PGN3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dclk2Q6PGN3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dclk2Q6PGN3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dclk2Q6PGN3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dclk2Q6PGN3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dclk2Q6PGN3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dclk2Q6PGN3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dclk2Q6PGN3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dclk2Q6PGN3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dclk2Q6PGN3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dclk2Q6PGN3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dclk2Q6PGN3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dclk2Q6PGN3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dclk2Q6PGN3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dclk2Q6PGN3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dclk2Q6PGN3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dclk2Q6PGN3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dclk2Q6PGN3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dclk2Q6PGN3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dclk2Q6PGN3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dclk2Q6PGN3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dclk2Q6PGN3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dclk2Q6PGN3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dclk2Q6PGN3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dclk2Q6PGN3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dclk2Q6PGN3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dclk2Q6PGN3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dclk2Q6PGN3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dclk2Q6PGN3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dclk2Q6PGN3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dclk2Q6PGN3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Dclk2Q6PGN3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Dclk2Q6PGN3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dclk2Q6PGN3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dclk2Q6PGN3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Dclk2Q6PGN3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dclk2Q6PGN3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dclk2Q6PGN3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dclk2Q6PGN3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Dclk2Q6PGN3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dclk2Q6PGN3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dclk2Q6PGN3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dclk2Q6PGN3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dclk2Q6PGN3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dclk2Q6PGN3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms