Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF5

Bms1, BMS1 homolog, ribosome assembly protein (Yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bms1Q6PGF5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Bms1Q6PGF5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Bms1Q6PGF5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Bms1Q6PGF5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Bms1Q6PGF5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Bms1Q6PGF5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Bms1Q6PGF5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Bms1Q6PGF5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Bms1Q6PGF5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Bms1Q6PGF5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Bms1Q6PGF5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Bms1Q6PGF5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Bms1Q6PGF5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Bms1Q6PGF5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Bms1Q6PGF5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Bms1Q6PGF5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Bms1Q6PGF5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Bms1Q6PGF5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Bms1Q6PGF5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Bms1Q6PGF5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Bms1Q6PGF5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Bms1Q6PGF5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Bms1Q6PGF5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Bms1Q6PGF5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Bms1Q6PGF5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Bms1Q6PGF5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Bms1Q6PGF5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Bms1Q6PGF5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Bms1Q6PGF5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Bms1Q6PGF5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Bms1Q6PGF5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Bms1Q6PGF5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Bms1Q6PGF5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Bms1Q6PGF5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Bms1Q6PGF5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Bms1Q6PGF5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Bms1Q6PGF5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Bms1Q6PGF5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Bms1Q6PGF5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Bms1Q6PGF5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Bms1Q6PGF5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Bms1Q6PGF5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Bms1Q6PGF5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Bms1Q6PGF5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Bms1Q6PGF5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Bms1Q6PGF5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Bms1Q6PGF5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Bms1Q6PGF5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Bms1Q6PGF5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Bms1Q6PGF5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Bms1Q6PGF5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Bms1Q6PGF5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Bms1Q6PGF5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Bms1Q6PGF5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Bms1Q6PGF5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Bms1Q6PGF5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Bms1Q6PGF5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Bms1Q6PGF5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Bms1Q6PGF5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Bms1Q6PGF5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Bms1Q6PGF5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Bms1Q6PGF5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Bms1Q6PGF5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Bms1Q6PGF5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Bms1Q6PGF5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Bms1Q6PGF5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Bms1Q6PGF5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Bms1Q6PGF5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Bms1Q6PGF5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Bms1Q6PGF5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Bms1Q6PGF5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Bms1Q6PGF5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Bms1Q6PGF5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Bms1Q6PGF5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Bms1Q6PGF5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Bms1Q6PGF5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Bms1Q6PGF5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Bms1Q6PGF5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Bms1Q6PGF5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Bms1Q6PGF5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Bms1Q6PGF5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Bms1Q6PGF5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Bms1Q6PGF5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Bms1Q6PGF5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Bms1Q6PGF5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Bms1Q6PGF5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Bms1Q6PGF5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Bms1Q6PGF5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Bms1Q6PGF5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Bms1Q6PGF5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Bms1Q6PGF5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Bms1Q6PGF5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Bms1Q6PGF5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Bms1Q6PGF5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Bms1Q6PGF5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Bms1Q6PGF5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Bms1Q6PGF5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Bms1Q6PGF5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Bms1Q6PGF5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Bms1Q6PGF5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms