Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Med16Q6PGF3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Med16Q6PGF3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Med16Q6PGF3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Med16Q6PGF3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Med16Q6PGF3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Med16Q6PGF3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Med16Q6PGF3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Med16Q6PGF3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Med16Q6PGF3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Med16Q6PGF3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Med16Q6PGF3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Med16Q6PGF3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Med16Q6PGF3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Med16Q6PGF3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Med16Q6PGF3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Med16Q6PGF3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Med16Q6PGF3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Med16Q6PGF3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Med16Q6PGF3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Med16Q6PGF3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Med16Q6PGF3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Med16Q6PGF3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Med16Q6PGF3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Med16Q6PGF3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Med16Q6PGF3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Med16Q6PGF3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Med16Q6PGF3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Med16Q6PGF3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Med16Q6PGF3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Med16Q6PGF3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Med16Q6PGF3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Med16Q6PGF3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Med16Q6PGF3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Med16Q6PGF3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Med16Q6PGF3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Med16Q6PGF3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Med16Q6PGF3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Med16Q6PGF3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Med16Q6PGF3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Med16Q6PGF3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Med16Q6PGF3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Med16Q6PGF3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Med16Q6PGF3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Med16Q6PGF3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Med16Q6PGF3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Med16Q6PGF3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Med16Q6PGF3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Med16Q6PGF3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Med16Q6PGF3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Med16Q6PGF3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med16Q6PGF3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med16Q6PGF3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med16Q6PGF3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med16Q6PGF3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med16Q6PGF3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med16Q6PGF3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med16Q6PGF3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med16Q6PGF3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med16Q6PGF3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Med16Q6PGF3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med16Q6PGF3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med16Q6PGF3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med16Q6PGF3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Med16Q6PGF3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Med16Q6PGF3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Med16Q6PGF3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Med16Q6PGF3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Med16Q6PGF3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Med16Q6PGF3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Med16Q6PGF3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Med16Q6PGF3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med16Q6PGF3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med16Q6PGF3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med16Q6PGF3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med16Q6PGF3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med16Q6PGF3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med16Q6PGF3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med16Q6PGF3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med16Q6PGF3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med16Q6PGF3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med16Q6PGF3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med16Q6PGF3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med16Q6PGF3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med16Q6PGF3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med16Q6PGF3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med16Q6PGF3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med16Q6PGF3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med16Q6PGF3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med16Q6PGF3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Med16Q6PGF3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med16Q6PGF3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med16Q6PGF3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Med16Q6PGF3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Med16Q6PGF3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Med16Q6PGF3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Med16Q6PGF3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Med16Q6PGF3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Med16Q6PGF3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Med16Q6PGF3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms