Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CtifQ6PEE2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CtifQ6PEE2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CtifQ6PEE2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CtifQ6PEE2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CtifQ6PEE2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CtifQ6PEE2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms