Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CtifQ6PEE2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CtifQ6PEE2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CtifQ6PEE2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CtifQ6PEE2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CtifQ6PEE2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CtifQ6PEE2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CtifQ6PEE2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CtifQ6PEE2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CtifQ6PEE2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CtifQ6PEE2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
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