Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Prkab2Q6PAM0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Prkab2Q6PAM0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Prkab2Q6PAM0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prkab2Q6PAM0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prkab2Q6PAM0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prkab2Q6PAM0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prkab2Q6PAM0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prkab2Q6PAM0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prkab2Q6PAM0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prkab2Q6PAM0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prkab2Q6PAM0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prkab2Q6PAM0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prkab2Q6PAM0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Prkab2Q6PAM0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prkab2Q6PAM0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prkab2Q6PAM0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prkab2Q6PAM0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prkab2Q6PAM0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prkab2Q6PAM0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prkab2Q6PAM0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prkab2Q6PAM0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prkab2Q6PAM0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prkab2Q6PAM0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prkab2Q6PAM0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prkab2Q6PAM0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prkab2Q6PAM0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prkab2Q6PAM0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prkab2Q6PAM0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prkab2Q6PAM0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prkab2Q6PAM0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prkab2Q6PAM0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prkab2Q6PAM0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prkab2Q6PAM0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prkab2Q6PAM0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prkab2Q6PAM0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prkab2Q6PAM0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prkab2Q6PAM0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prkab2Q6PAM0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prkab2Q6PAM0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Prkab2Q6PAM0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prkab2Q6PAM0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prkab2Q6PAM0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Prkab2Q6PAM0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prkab2Q6PAM0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prkab2Q6PAM0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Prkab2Q6PAM0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prkab2Q6PAM0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prkab2Q6PAM0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prkab2Q6PAM0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prkab2Q6PAM0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prkab2Q6PAM0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prkab2Q6PAM0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prkab2Q6PAM0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prkab2Q6PAM0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prkab2Q6PAM0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prkab2Q6PAM0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prkab2Q6PAM0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prkab2Q6PAM0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prkab2Q6PAM0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prkab2Q6PAM0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prkab2Q6PAM0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prkab2Q6PAM0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prkab2Q6PAM0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prkab2Q6PAM0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prkab2Q6PAM0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prkab2Q6PAM0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prkab2Q6PAM0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Prkab2Q6PAM0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Prkab2Q6PAM0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Prkab2Q6PAM0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prkab2Q6PAM0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prkab2Q6PAM0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prkab2Q6PAM0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prkab2Q6PAM0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prkab2Q6PAM0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prkab2Q6PAM0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prkab2Q6PAM0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Prkab2Q6PAM0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prkab2Q6PAM0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prkab2Q6PAM0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prkab2Q6PAM0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prkab2Q6PAM0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prkab2Q6PAM0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prkab2Q6PAM0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prkab2Q6PAM0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prkab2Q6PAM0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prkab2Q6PAM0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prkab2Q6PAM0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prkab2Q6PAM0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prkab2Q6PAM0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prkab2Q6PAM0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prkab2Q6PAM0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prkab2Q6PAM0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prkab2Q6PAM0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prkab2Q6PAM0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prkab2Q6PAM0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prkab2Q6PAM0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prkab2Q6PAM0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prkab2Q6PAM0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms