Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BC061212Q6P8K3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BC061212Q6P8K3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
BC061212Q6P8K3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BC061212Q6P8K3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BC061212Q6P8K3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BC061212Q6P8K3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BC061212Q6P8K3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BC061212Q6P8K3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BC061212Q6P8K3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BC061212Q6P8K3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BC061212Q6P8K3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BC061212Q6P8K3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BC061212Q6P8K3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BC061212Q6P8K3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BC061212Q6P8K3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BC061212Q6P8K3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BC061212Q6P8K3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BC061212Q6P8K3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BC061212Q6P8K3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BC061212Q6P8K3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BC061212Q6P8K3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BC061212Q6P8K3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BC061212Q6P8K3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BC061212Q6P8K3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
BC061212Q6P8K3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BC061212Q6P8K3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BC061212Q6P8K3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BC061212Q6P8K3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BC061212Q6P8K3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BC061212Q6P8K3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BC061212Q6P8K3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BC061212Q6P8K3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BC061212Q6P8K3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BC061212Q6P8K3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BC061212Q6P8K3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BC061212Q6P8K3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BC061212Q6P8K3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BC061212Q6P8K3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BC061212Q6P8K3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
BC061212Q6P8K3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BC061212Q6P8K3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BC061212Q6P8K3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BC061212Q6P8K3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BC061212Q6P8K3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BC061212Q6P8K3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BC061212Q6P8K3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BC061212Q6P8K3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BC061212Q6P8K3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BC061212Q6P8K3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BC061212Q6P8K3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BC061212Q6P8K3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BC061212Q6P8K3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BC061212Q6P8K3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BC061212Q6P8K3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BC061212Q6P8K3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BC061212Q6P8K3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BC061212Q6P8K3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BC061212Q6P8K3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BC061212Q6P8K3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BC061212Q6P8K3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms