Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg2aQ6P4T0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg2aQ6P4T0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg2aQ6P4T0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg2aQ6P4T0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg2aQ6P4T0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg2aQ6P4T0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg2aQ6P4T0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg2aQ6P4T0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg2aQ6P4T0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg2aQ6P4T0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg2aQ6P4T0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg2aQ6P4T0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg2aQ6P4T0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg2aQ6P4T0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg2aQ6P4T0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg2aQ6P4T0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg2aQ6P4T0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg2aQ6P4T0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg2aQ6P4T0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg2aQ6P4T0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg2aQ6P4T0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg2aQ6P4T0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg2aQ6P4T0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atg2aQ6P4T0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Atg2aQ6P4T0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atg2aQ6P4T0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atg2aQ6P4T0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg2aQ6P4T0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg2aQ6P4T0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg2aQ6P4T0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg2aQ6P4T0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg2aQ6P4T0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg2aQ6P4T0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg2aQ6P4T0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg2aQ6P4T0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg2aQ6P4T0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg2aQ6P4T0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg2aQ6P4T0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg2aQ6P4T0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg2aQ6P4T0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg2aQ6P4T0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg2aQ6P4T0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg2aQ6P4T0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg2aQ6P4T0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg2aQ6P4T0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg2aQ6P4T0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg2aQ6P4T0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg2aQ6P4T0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg2aQ6P4T0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg2aQ6P4T0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg2aQ6P4T0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg2aQ6P4T0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg2aQ6P4T0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg2aQ6P4T0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg2aQ6P4T0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg2aQ6P4T0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg2aQ6P4T0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg2aQ6P4T0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg2aQ6P4T0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg2aQ6P4T0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg2aQ6P4T0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg2aQ6P4T0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg2aQ6P4T0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg2aQ6P4T0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg2aQ6P4T0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg2aQ6P4T0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg2aQ6P4T0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg2aQ6P4T0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg2aQ6P4T0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg2aQ6P4T0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg2aQ6P4T0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg2aQ6P4T0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg2aQ6P4T0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg2aQ6P4T0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg2aQ6P4T0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg2aQ6P4T0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg2aQ6P4T0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg2aQ6P4T0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Atg2aQ6P4T0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg2aQ6P4T0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg2aQ6P4T0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg2aQ6P4T0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg2aQ6P4T0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg2aQ6P4T0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg2aQ6P4T0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg2aQ6P4T0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg2aQ6P4T0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg2aQ6P4T0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg2aQ6P4T0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg2aQ6P4T0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg2aQ6P4T0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg2aQ6P4T0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg2aQ6P4T0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg2aQ6P4T0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg2aQ6P4T0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg2aQ6P4T0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg2aQ6P4T0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg2aQ6P4T0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg2aQ6P4T0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms