Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casc4Q6P2L7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casc4Q6P2L7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casc4Q6P2L7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casc4Q6P2L7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casc4Q6P2L7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casc4Q6P2L7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casc4Q6P2L7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casc4Q6P2L7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casc4Q6P2L7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casc4Q6P2L7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casc4Q6P2L7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casc4Q6P2L7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casc4Q6P2L7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casc4Q6P2L7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Casc4Q6P2L7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Casc4Q6P2L7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casc4Q6P2L7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casc4Q6P2L7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casc4Q6P2L7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casc4Q6P2L7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casc4Q6P2L7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Casc4Q6P2L7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casc4Q6P2L7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casc4Q6P2L7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casc4Q6P2L7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casc4Q6P2L7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casc4Q6P2L7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casc4Q6P2L7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Casc4Q6P2L7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casc4Q6P2L7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casc4Q6P2L7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casc4Q6P2L7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casc4Q6P2L7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casc4Q6P2L7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casc4Q6P2L7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casc4Q6P2L7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casc4Q6P2L7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casc4Q6P2L7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casc4Q6P2L7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casc4Q6P2L7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casc4Q6P2L7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casc4Q6P2L7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casc4Q6P2L7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Casc4Q6P2L7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casc4Q6P2L7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casc4Q6P2L7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Casc4Q6P2L7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Casc4Q6P2L7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Casc4Q6P2L7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Casc4Q6P2L7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Casc4Q6P2L7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casc4Q6P2L7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casc4Q6P2L7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casc4Q6P2L7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Casc4Q6P2L7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casc4Q6P2L7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casc4Q6P2L7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casc4Q6P2L7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casc4Q6P2L7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casc4Q6P2L7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casc4Q6P2L7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casc4Q6P2L7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casc4Q6P2L7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casc4Q6P2L7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casc4Q6P2L7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casc4Q6P2L7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casc4Q6P2L7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casc4Q6P2L7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casc4Q6P2L7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casc4Q6P2L7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casc4Q6P2L7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casc4Q6P2L7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casc4Q6P2L7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Casc4Q6P2L7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Casc4Q6P2L7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casc4Q6P2L7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casc4Q6P2L7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casc4Q6P2L7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casc4Q6P2L7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casc4Q6P2L7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casc4Q6P2L7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casc4Q6P2L7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casc4Q6P2L7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Casc4Q6P2L7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casc4Q6P2L7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casc4Q6P2L7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casc4Q6P2L7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casc4Q6P2L7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casc4Q6P2L7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casc4Q6P2L7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Casc4Q6P2L7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casc4Q6P2L7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casc4Q6P2L7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casc4Q6P2L7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casc4Q6P2L7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Casc4Q6P2L7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Casc4Q6P2L7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casc4Q6P2L7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casc4Q6P2L7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms