Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrig3Q6P1C6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lrig3Q6P1C6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrig3Q6P1C6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrig3Q6P1C6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrig3Q6P1C6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrig3Q6P1C6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrig3Q6P1C6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrig3Q6P1C6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrig3Q6P1C6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrig3Q6P1C6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrig3Q6P1C6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrig3Q6P1C6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrig3Q6P1C6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrig3Q6P1C6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrig3Q6P1C6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrig3Q6P1C6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrig3Q6P1C6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrig3Q6P1C6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrig3Q6P1C6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrig3Q6P1C6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrig3Q6P1C6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrig3Q6P1C6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrig3Q6P1C6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrig3Q6P1C6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrig3Q6P1C6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrig3Q6P1C6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrig3Q6P1C6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrig3Q6P1C6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrig3Q6P1C6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrig3Q6P1C6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrig3Q6P1C6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrig3Q6P1C6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrig3Q6P1C6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrig3Q6P1C6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrig3Q6P1C6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrig3Q6P1C6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrig3Q6P1C6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrig3Q6P1C6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrig3Q6P1C6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrig3Q6P1C6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrig3Q6P1C6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrig3Q6P1C6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrig3Q6P1C6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrig3Q6P1C6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrig3Q6P1C6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrig3Q6P1C6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrig3Q6P1C6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrig3Q6P1C6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrig3Q6P1C6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrig3Q6P1C6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrig3Q6P1C6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrig3Q6P1C6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrig3Q6P1C6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrig3Q6P1C6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrig3Q6P1C6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrig3Q6P1C6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrig3Q6P1C6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrig3Q6P1C6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrig3Q6P1C6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrig3Q6P1C6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrig3Q6P1C6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrig3Q6P1C6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrig3Q6P1C6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrig3Q6P1C6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrig3Q6P1C6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrig3Q6P1C6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrig3Q6P1C6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrig3Q6P1C6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrig3Q6P1C6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrig3Q6P1C6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrig3Q6P1C6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrig3Q6P1C6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrig3Q6P1C6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrig3Q6P1C6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrig3Q6P1C6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrig3Q6P1C6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrig3Q6P1C6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrig3Q6P1C6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrig3Q6P1C6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrig3Q6P1C6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrig3Q6P1C6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrig3Q6P1C6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrig3Q6P1C6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrig3Q6P1C6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrig3Q6P1C6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrig3Q6P1C6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrig3Q6P1C6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrig3Q6P1C6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrig3Q6P1C6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrig3Q6P1C6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrig3Q6P1C6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrig3Q6P1C6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrig3Q6P1C6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrig3Q6P1C6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrig3Q6P1C6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrig3Q6P1C6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrig3Q6P1C6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrig3Q6P1C6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrig3Q6P1C6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms