Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Pdcd11Q6NS46 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Pdcd11Q6NS46 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Pdcd11Q6NS46 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Pdcd11Q6NS46 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Pdcd11Q6NS46 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Pdcd11Q6NS46 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Pdcd11Q6NS46 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Pdcd11Q6NS46 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Pdcd11Q6NS46 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Pdcd11Q6NS46 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Pdcd11Q6NS46 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Pdcd11Q6NS46 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Pdcd11Q6NS46 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Pdcd11Q6NS46 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Pdcd11Q6NS46 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Pdcd11Q6NS46 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Pdcd11Q6NS46 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Pdcd11Q6NS46 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Pdcd11Q6NS46 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Pdcd11Q6NS46 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Pdcd11Q6NS46 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Pdcd11Q6NS46 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Pdcd11Q6NS46 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Pdcd11Q6NS46 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Pdcd11Q6NS46 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Pdcd11Q6NS46 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Pdcd11Q6NS46 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Pdcd11Q6NS46 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Pdcd11Q6NS46 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Pdcd11Q6NS46 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Pdcd11Q6NS46 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Pdcd11Q6NS46 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Pdcd11Q6NS46 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Pdcd11Q6NS46 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Pdcd11Q6NS46 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Pdcd11Q6NS46 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Pdcd11Q6NS46 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Pdcd11Q6NS46 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Pdcd11Q6NS46 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Pdcd11Q6NS46 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Pdcd11Q6NS46 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Pdcd11Q6NS46 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Pdcd11Q6NS46 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Pdcd11Q6NS46 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Pdcd11Q6NS46 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Pdcd11Q6NS46 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Pdcd11Q6NS46 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
Pdcd11Q6NS46 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Pdcd11Q6NS46 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Pdcd11Q6NS46 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Pdcd11Q6NS46 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Pdcd11Q6NS46 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Pdcd11Q6NS46 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Pdcd11Q6NS46 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Pdcd11Q6NS46 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Pdcd11Q6NS46 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Pdcd11Q6NS46 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Pdcd11Q6NS46 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Pdcd11Q6NS46 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Pdcd11Q6NS46 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Pdcd11Q6NS46 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Pdcd11Q6NS46 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Pdcd11Q6NS46 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Pdcd11Q6NS46 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Pdcd11Q6NS46 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Pdcd11Q6NS46 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Pdcd11Q6NS46 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Pdcd11Q6NS46 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Pdcd11Q6NS46 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Pdcd11Q6NS46 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Pdcd11Q6NS46 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Pdcd11Q6NS46 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Pdcd11Q6NS46 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Pdcd11Q6NS46 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Pdcd11Q6NS46 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Pdcd11Q6NS46 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Pdcd11Q6NS46 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Pdcd11Q6NS46 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Pdcd11Q6NS46 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Pdcd11Q6NS46 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Pdcd11Q6NS46 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Pdcd11Q6NS46 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Pdcd11Q6NS46 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Pdcd11Q6NS46 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Pdcd11Q6NS46 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Pdcd11Q6NS46 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Pdcd11Q6NS46 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Pdcd11Q6NS46 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Pdcd11Q6NS46 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Pdcd11Q6NS46 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Pdcd11Q6NS46 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Pdcd11Q6NS46 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Pdcd11Q6NS46 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Pdcd11Q6NS46 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Pdcd11Q6NS46 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Pdcd11Q6NS46 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Pdcd11Q6NS46 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Pdcd11Q6NS46 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Pdcd11Q6NS46 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms