Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KdsrQ6GV12 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KdsrQ6GV12 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KdsrQ6GV12 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KdsrQ6GV12 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KdsrQ6GV12 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KdsrQ6GV12 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KdsrQ6GV12 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KdsrQ6GV12 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KdsrQ6GV12 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KdsrQ6GV12 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KdsrQ6GV12 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KdsrQ6GV12 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KdsrQ6GV12 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KdsrQ6GV12 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KdsrQ6GV12 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KdsrQ6GV12 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KdsrQ6GV12 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KdsrQ6GV12 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KdsrQ6GV12 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KdsrQ6GV12 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KdsrQ6GV12 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KdsrQ6GV12 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KdsrQ6GV12 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KdsrQ6GV12 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KdsrQ6GV12 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KdsrQ6GV12 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KdsrQ6GV12 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KdsrQ6GV12 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KdsrQ6GV12 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KdsrQ6GV12 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KdsrQ6GV12 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KdsrQ6GV12 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KdsrQ6GV12 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KdsrQ6GV12 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KdsrQ6GV12 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KdsrQ6GV12 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KdsrQ6GV12 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KdsrQ6GV12 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KdsrQ6GV12 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KdsrQ6GV12 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KdsrQ6GV12 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KdsrQ6GV12 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KdsrQ6GV12 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KdsrQ6GV12 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KdsrQ6GV12 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KdsrQ6GV12 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KdsrQ6GV12 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KdsrQ6GV12 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KdsrQ6GV12 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KdsrQ6GV12 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KdsrQ6GV12 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KdsrQ6GV12 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KdsrQ6GV12 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KdsrQ6GV12 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KdsrQ6GV12 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KdsrQ6GV12 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KdsrQ6GV12 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KdsrQ6GV12 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KdsrQ6GV12 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KdsrQ6GV12 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KdsrQ6GV12 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KdsrQ6GV12 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KdsrQ6GV12 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KdsrQ6GV12 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KdsrQ6GV12 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KdsrQ6GV12 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KdsrQ6GV12 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KdsrQ6GV12 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KdsrQ6GV12 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KdsrQ6GV12 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KdsrQ6GV12 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KdsrQ6GV12 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KdsrQ6GV12 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KdsrQ6GV12 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KdsrQ6GV12 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KdsrQ6GV12 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KdsrQ6GV12 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KdsrQ6GV12 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KdsrQ6GV12 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KdsrQ6GV12 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KdsrQ6GV12 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KdsrQ6GV12 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KdsrQ6GV12 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KdsrQ6GV12 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KdsrQ6GV12 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KdsrQ6GV12 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KdsrQ6GV12 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KdsrQ6GV12 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KdsrQ6GV12 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KdsrQ6GV12 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KdsrQ6GV12 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KdsrQ6GV12 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KdsrQ6GV12 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KdsrQ6GV12 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KdsrQ6GV12 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KdsrQ6GV12 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KdsrQ6GV12 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KdsrQ6GV12 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KdsrQ6GV12 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms