Protein–RNA interactions for Protein: Q6GSS7

Hist2h2aa1, Histone H2A type 2-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2aa1Q6GSS7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hist2h2aa1Q6GSS7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hist2h2aa1Q6GSS7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hist2h2aa1Q6GSS7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hist2h2aa1Q6GSS7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hist2h2aa1Q6GSS7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hist2h2aa1Q6GSS7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hist2h2aa1Q6GSS7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hist2h2aa1Q6GSS7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hist2h2aa1Q6GSS7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hist2h2aa1Q6GSS7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hist2h2aa1Q6GSS7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hist2h2aa1Q6GSS7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hist2h2aa1Q6GSS7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hist2h2aa1Q6GSS7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hist2h2aa1Q6GSS7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms