Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Edrf1Q6GQV7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Edrf1Q6GQV7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Edrf1Q6GQV7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Edrf1Q6GQV7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Edrf1Q6GQV7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Edrf1Q6GQV7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Edrf1Q6GQV7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Edrf1Q6GQV7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Edrf1Q6GQV7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Edrf1Q6GQV7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Edrf1Q6GQV7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Edrf1Q6GQV7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Edrf1Q6GQV7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Edrf1Q6GQV7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Edrf1Q6GQV7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Edrf1Q6GQV7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Edrf1Q6GQV7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Edrf1Q6GQV7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Edrf1Q6GQV7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Edrf1Q6GQV7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Edrf1Q6GQV7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Edrf1Q6GQV7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Edrf1Q6GQV7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Edrf1Q6GQV7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Edrf1Q6GQV7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Edrf1Q6GQV7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Edrf1Q6GQV7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Edrf1Q6GQV7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Edrf1Q6GQV7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Edrf1Q6GQV7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Edrf1Q6GQV7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Edrf1Q6GQV7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Edrf1Q6GQV7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Edrf1Q6GQV7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Edrf1Q6GQV7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Edrf1Q6GQV7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Edrf1Q6GQV7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Edrf1Q6GQV7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Edrf1Q6GQV7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Edrf1Q6GQV7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Edrf1Q6GQV7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Edrf1Q6GQV7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Edrf1Q6GQV7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Edrf1Q6GQV7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Edrf1Q6GQV7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Edrf1Q6GQV7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Edrf1Q6GQV7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Edrf1Q6GQV7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Edrf1Q6GQV7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Edrf1Q6GQV7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Edrf1Q6GQV7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Edrf1Q6GQV7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Edrf1Q6GQV7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Edrf1Q6GQV7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Edrf1Q6GQV7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Edrf1Q6GQV7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Edrf1Q6GQV7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Edrf1Q6GQV7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Edrf1Q6GQV7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Edrf1Q6GQV7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Edrf1Q6GQV7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Edrf1Q6GQV7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Edrf1Q6GQV7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Edrf1Q6GQV7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Edrf1Q6GQV7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Edrf1Q6GQV7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Edrf1Q6GQV7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Edrf1Q6GQV7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Edrf1Q6GQV7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Edrf1Q6GQV7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Edrf1Q6GQV7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Edrf1Q6GQV7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Edrf1Q6GQV7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Edrf1Q6GQV7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Edrf1Q6GQV7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Edrf1Q6GQV7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Edrf1Q6GQV7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Edrf1Q6GQV7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Edrf1Q6GQV7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Edrf1Q6GQV7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Edrf1Q6GQV7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Edrf1Q6GQV7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Edrf1Q6GQV7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Edrf1Q6GQV7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Edrf1Q6GQV7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Edrf1Q6GQV7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Edrf1Q6GQV7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Edrf1Q6GQV7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Edrf1Q6GQV7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Edrf1Q6GQV7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Edrf1Q6GQV7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Edrf1Q6GQV7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Edrf1Q6GQV7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Edrf1Q6GQV7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Edrf1Q6GQV7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Edrf1Q6GQV7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Edrf1Q6GQV7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Edrf1Q6GQV7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Edrf1Q6GQV7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.7 ms