Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp11bQ6DFW5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp11bQ6DFW5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp11bQ6DFW5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp11bQ6DFW5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp11bQ6DFW5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp11bQ6DFW5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp11bQ6DFW5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp11bQ6DFW5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp11bQ6DFW5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp11bQ6DFW5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp11bQ6DFW5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp11bQ6DFW5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp11bQ6DFW5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp11bQ6DFW5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atp11bQ6DFW5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp11bQ6DFW5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp11bQ6DFW5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp11bQ6DFW5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp11bQ6DFW5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp11bQ6DFW5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp11bQ6DFW5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp11bQ6DFW5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp11bQ6DFW5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp11bQ6DFW5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp11bQ6DFW5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp11bQ6DFW5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp11bQ6DFW5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp11bQ6DFW5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp11bQ6DFW5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp11bQ6DFW5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp11bQ6DFW5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp11bQ6DFW5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp11bQ6DFW5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp11bQ6DFW5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp11bQ6DFW5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp11bQ6DFW5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp11bQ6DFW5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp11bQ6DFW5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp11bQ6DFW5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp11bQ6DFW5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp11bQ6DFW5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp11bQ6DFW5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp11bQ6DFW5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp11bQ6DFW5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp11bQ6DFW5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp11bQ6DFW5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp11bQ6DFW5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp11bQ6DFW5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp11bQ6DFW5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp11bQ6DFW5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp11bQ6DFW5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atp11bQ6DFW5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp11bQ6DFW5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp11bQ6DFW5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp11bQ6DFW5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp11bQ6DFW5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp11bQ6DFW5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp11bQ6DFW5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp11bQ6DFW5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp11bQ6DFW5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp11bQ6DFW5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp11bQ6DFW5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp11bQ6DFW5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp11bQ6DFW5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp11bQ6DFW5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp11bQ6DFW5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp11bQ6DFW5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp11bQ6DFW5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp11bQ6DFW5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp11bQ6DFW5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp11bQ6DFW5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp11bQ6DFW5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp11bQ6DFW5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp11bQ6DFW5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp11bQ6DFW5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp11bQ6DFW5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp11bQ6DFW5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp11bQ6DFW5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp11bQ6DFW5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp11bQ6DFW5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp11bQ6DFW5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp11bQ6DFW5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp11bQ6DFW5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp11bQ6DFW5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp11bQ6DFW5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp11bQ6DFW5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp11bQ6DFW5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp11bQ6DFW5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp11bQ6DFW5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp11bQ6DFW5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp11bQ6DFW5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp11bQ6DFW5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp11bQ6DFW5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp11bQ6DFW5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp11bQ6DFW5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp11bQ6DFW5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp11bQ6DFW5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp11bQ6DFW5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp11bQ6DFW5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143 ms