Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Nop58Q6DFW4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Nop58Q6DFW4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Nop58Q6DFW4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Nop58Q6DFW4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Nop58Q6DFW4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Nop58Q6DFW4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Nop58Q6DFW4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Nop58Q6DFW4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Nop58Q6DFW4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Nop58Q6DFW4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
Nop58Q6DFW4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Nop58Q6DFW4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Nop58Q6DFW4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Nop58Q6DFW4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Nop58Q6DFW4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Nop58Q6DFW4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Nop58Q6DFW4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Nop58Q6DFW4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Nop58Q6DFW4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Nop58Q6DFW4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Nop58Q6DFW4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Nop58Q6DFW4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Nop58Q6DFW4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Nop58Q6DFW4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Nop58Q6DFW4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nop58Q6DFW4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nop58Q6DFW4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nop58Q6DFW4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nop58Q6DFW4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Nop58Q6DFW4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Nop58Q6DFW4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Nop58Q6DFW4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Nop58Q6DFW4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Nop58Q6DFW4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Nop58Q6DFW4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Nop58Q6DFW4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Nop58Q6DFW4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Nop58Q6DFW4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Nop58Q6DFW4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Nop58Q6DFW4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Nop58Q6DFW4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Nop58Q6DFW4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Nop58Q6DFW4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Nop58Q6DFW4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Nop58Q6DFW4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Nop58Q6DFW4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Nop58Q6DFW4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Nop58Q6DFW4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Nop58Q6DFW4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Nop58Q6DFW4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Nop58Q6DFW4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Nop58Q6DFW4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Nop58Q6DFW4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Nop58Q6DFW4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Nop58Q6DFW4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Nop58Q6DFW4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Nop58Q6DFW4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Nop58Q6DFW4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Nop58Q6DFW4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Nop58Q6DFW4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Nop58Q6DFW4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Nop58Q6DFW4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Nop58Q6DFW4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Nop58Q6DFW4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Nop58Q6DFW4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nop58Q6DFW4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nop58Q6DFW4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Nop58Q6DFW4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Nop58Q6DFW4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Nop58Q6DFW4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Nop58Q6DFW4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Nop58Q6DFW4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Nop58Q6DFW4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Nop58Q6DFW4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Nop58Q6DFW4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Nop58Q6DFW4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Nop58Q6DFW4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Nop58Q6DFW4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Nop58Q6DFW4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Nop58Q6DFW4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Nop58Q6DFW4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Nop58Q6DFW4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Nop58Q6DFW4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Nop58Q6DFW4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Nop58Q6DFW4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Nop58Q6DFW4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Nop58Q6DFW4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Nop58Q6DFW4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Nop58Q6DFW4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Nop58Q6DFW4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Nop58Q6DFW4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Nop58Q6DFW4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Nop58Q6DFW4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Nop58Q6DFW4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Nop58Q6DFW4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Nop58Q6DFW4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Nop58Q6DFW4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Nop58Q6DFW4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Nop58Q6DFW4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms