Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Q6DFW0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q6DFW0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q6DFW0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q6DFW0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q6DFW0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q6DFW0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q6DFW0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q6DFW0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q6DFW0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q6DFW0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Q6DFW0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q6DFW0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q6DFW0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q6DFW0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q6DFW0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms