Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp7Q6A4J8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp7Q6A4J8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp7Q6A4J8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp7Q6A4J8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp7Q6A4J8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp7Q6A4J8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp7Q6A4J8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp7Q6A4J8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp7Q6A4J8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp7Q6A4J8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp7Q6A4J8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp7Q6A4J8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp7Q6A4J8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp7Q6A4J8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp7Q6A4J8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp7Q6A4J8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp7Q6A4J8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp7Q6A4J8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp7Q6A4J8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp7Q6A4J8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp7Q6A4J8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp7Q6A4J8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp7Q6A4J8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp7Q6A4J8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp7Q6A4J8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp7Q6A4J8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp7Q6A4J8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp7Q6A4J8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp7Q6A4J8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp7Q6A4J8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp7Q6A4J8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp7Q6A4J8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp7Q6A4J8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp7Q6A4J8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp7Q6A4J8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp7Q6A4J8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp7Q6A4J8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp7Q6A4J8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp7Q6A4J8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp7Q6A4J8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp7Q6A4J8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp7Q6A4J8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp7Q6A4J8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp7Q6A4J8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp7Q6A4J8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp7Q6A4J8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp7Q6A4J8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp7Q6A4J8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp7Q6A4J8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp7Q6A4J8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp7Q6A4J8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp7Q6A4J8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp7Q6A4J8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp7Q6A4J8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp7Q6A4J8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp7Q6A4J8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp7Q6A4J8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp7Q6A4J8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp7Q6A4J8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp7Q6A4J8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp7Q6A4J8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp7Q6A4J8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp7Q6A4J8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp7Q6A4J8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp7Q6A4J8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp7Q6A4J8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp7Q6A4J8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp7Q6A4J8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp7Q6A4J8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp7Q6A4J8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp7Q6A4J8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp7Q6A4J8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp7Q6A4J8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp7Q6A4J8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp7Q6A4J8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp7Q6A4J8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp7Q6A4J8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp7Q6A4J8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp7Q6A4J8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp7Q6A4J8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp7Q6A4J8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp7Q6A4J8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp7Q6A4J8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp7Q6A4J8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp7Q6A4J8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp7Q6A4J8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp7Q6A4J8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp7Q6A4J8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp7Q6A4J8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp7Q6A4J8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp7Q6A4J8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp7Q6A4J8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp7Q6A4J8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp7Q6A4J8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp7Q6A4J8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp7Q6A4J8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp7Q6A4J8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp7Q6A4J8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp7Q6A4J8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.4 ms