Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkp4Q68FH0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkp4Q68FH0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkp4Q68FH0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkp4Q68FH0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp4Q68FH0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp4Q68FH0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp4Q68FH0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp4Q68FH0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp4Q68FH0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkp4Q68FH0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkp4Q68FH0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkp4Q68FH0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pkp4Q68FH0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pkp4Q68FH0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkp4Q68FH0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkp4Q68FH0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkp4Q68FH0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pkp4Q68FH0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp4Q68FH0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pkp4Q68FH0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp4Q68FH0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp4Q68FH0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp4Q68FH0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp4Q68FH0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp4Q68FH0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp4Q68FH0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp4Q68FH0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pkp4Q68FH0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp4Q68FH0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp4Q68FH0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp4Q68FH0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp4Q68FH0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp4Q68FH0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp4Q68FH0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp4Q68FH0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pkp4Q68FH0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp4Q68FH0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp4Q68FH0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pkp4Q68FH0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkp4Q68FH0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkp4Q68FH0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkp4Q68FH0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pkp4Q68FH0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pkp4Q68FH0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkp4Q68FH0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkp4Q68FH0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pkp4Q68FH0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkp4Q68FH0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pkp4Q68FH0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp4Q68FH0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp4Q68FH0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp4Q68FH0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp4Q68FH0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp4Q68FH0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp4Q68FH0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp4Q68FH0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pkp4Q68FH0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkp4Q68FH0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkp4Q68FH0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkp4Q68FH0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkp4Q68FH0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkp4Q68FH0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkp4Q68FH0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkp4Q68FH0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkp4Q68FH0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkp4Q68FH0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pkp4Q68FH0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkp4Q68FH0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkp4Q68FH0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkp4Q68FH0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkp4Q68FH0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkp4Q68FH0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pkp4Q68FH0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkp4Q68FH0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkp4Q68FH0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pkp4Q68FH0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pkp4Q68FH0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pkp4Q68FH0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkp4Q68FH0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pkp4Q68FH0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp4Q68FH0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp4Q68FH0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp4Q68FH0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp4Q68FH0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp4Q68FH0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp4Q68FH0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pkp4Q68FH0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp4Q68FH0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp4Q68FH0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp4Q68FH0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp4Q68FH0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp4Q68FH0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp4Q68FH0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pkp4Q68FH0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkp4Q68FH0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp4Q68FH0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp4Q68FH0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkp4Q68FH0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkp4Q68FH0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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