Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab3ipQ68EF0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab3ipQ68EF0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab3ipQ68EF0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rab3ipQ68EF0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab3ipQ68EF0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab3ipQ68EF0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab3ipQ68EF0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab3ipQ68EF0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab3ipQ68EF0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab3ipQ68EF0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab3ipQ68EF0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab3ipQ68EF0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab3ipQ68EF0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab3ipQ68EF0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab3ipQ68EF0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab3ipQ68EF0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab3ipQ68EF0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab3ipQ68EF0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab3ipQ68EF0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab3ipQ68EF0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab3ipQ68EF0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab3ipQ68EF0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab3ipQ68EF0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab3ipQ68EF0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab3ipQ68EF0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab3ipQ68EF0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab3ipQ68EF0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab3ipQ68EF0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab3ipQ68EF0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab3ipQ68EF0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab3ipQ68EF0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab3ipQ68EF0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab3ipQ68EF0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab3ipQ68EF0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab3ipQ68EF0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab3ipQ68EF0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab3ipQ68EF0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab3ipQ68EF0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab3ipQ68EF0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab3ipQ68EF0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab3ipQ68EF0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab3ipQ68EF0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab3ipQ68EF0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab3ipQ68EF0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab3ipQ68EF0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab3ipQ68EF0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab3ipQ68EF0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3ipQ68EF0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3ipQ68EF0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3ipQ68EF0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3ipQ68EF0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab3ipQ68EF0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab3ipQ68EF0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab3ipQ68EF0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab3ipQ68EF0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab3ipQ68EF0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab3ipQ68EF0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab3ipQ68EF0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab3ipQ68EF0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab3ipQ68EF0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab3ipQ68EF0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms