Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT5

Tpgs2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs2Q66JT5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpgs2Q66JT5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpgs2Q66JT5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpgs2Q66JT5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpgs2Q66JT5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tpgs2Q66JT5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpgs2Q66JT5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpgs2Q66JT5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpgs2Q66JT5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpgs2Q66JT5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tpgs2Q66JT5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpgs2Q66JT5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpgs2Q66JT5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpgs2Q66JT5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpgs2Q66JT5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpgs2Q66JT5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpgs2Q66JT5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tpgs2Q66JT5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpgs2Q66JT5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tpgs2Q66JT5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpgs2Q66JT5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpgs2Q66JT5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpgs2Q66JT5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpgs2Q66JT5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpgs2Q66JT5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpgs2Q66JT5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpgs2Q66JT5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpgs2Q66JT5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpgs2Q66JT5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tpgs2Q66JT5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpgs2Q66JT5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpgs2Q66JT5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpgs2Q66JT5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpgs2Q66JT5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpgs2Q66JT5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpgs2Q66JT5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpgs2Q66JT5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tpgs2Q66JT5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpgs2Q66JT5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpgs2Q66JT5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpgs2Q66JT5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpgs2Q66JT5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpgs2Q66JT5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpgs2Q66JT5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpgs2Q66JT5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpgs2Q66JT5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpgs2Q66JT5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpgs2Q66JT5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpgs2Q66JT5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpgs2Q66JT5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpgs2Q66JT5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpgs2Q66JT5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpgs2Q66JT5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpgs2Q66JT5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpgs2Q66JT5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpgs2Q66JT5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpgs2Q66JT5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpgs2Q66JT5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpgs2Q66JT5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpgs2Q66JT5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpgs2Q66JT5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpgs2Q66JT5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpgs2Q66JT5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpgs2Q66JT5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpgs2Q66JT5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpgs2Q66JT5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpgs2Q66JT5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpgs2Q66JT5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpgs2Q66JT5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpgs2Q66JT5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpgs2Q66JT5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpgs2Q66JT5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpgs2Q66JT5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpgs2Q66JT5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpgs2Q66JT5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpgs2Q66JT5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpgs2Q66JT5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpgs2Q66JT5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpgs2Q66JT5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpgs2Q66JT5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpgs2Q66JT5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpgs2Q66JT5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpgs2Q66JT5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpgs2Q66JT5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpgs2Q66JT5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpgs2Q66JT5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpgs2Q66JT5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpgs2Q66JT5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpgs2Q66JT5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpgs2Q66JT5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpgs2Q66JT5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpgs2Q66JT5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpgs2Q66JT5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpgs2Q66JT5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpgs2Q66JT5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpgs2Q66JT5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpgs2Q66JT5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpgs2Q66JT5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpgs2Q66JT5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpgs2Q66JT5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms