Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Knl1Q66JQ7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Knl1Q66JQ7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Knl1Q66JQ7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Knl1Q66JQ7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Knl1Q66JQ7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Knl1Q66JQ7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Knl1Q66JQ7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Knl1Q66JQ7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Knl1Q66JQ7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Knl1Q66JQ7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
Knl1Q66JQ7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Knl1Q66JQ7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Knl1Q66JQ7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Knl1Q66JQ7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Knl1Q66JQ7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Knl1Q66JQ7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Knl1Q66JQ7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Knl1Q66JQ7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Knl1Q66JQ7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Knl1Q66JQ7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Knl1Q66JQ7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Knl1Q66JQ7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Knl1Q66JQ7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Knl1Q66JQ7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Knl1Q66JQ7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Knl1Q66JQ7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Knl1Q66JQ7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Knl1Q66JQ7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Knl1Q66JQ7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Knl1Q66JQ7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Knl1Q66JQ7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Knl1Q66JQ7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Knl1Q66JQ7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Knl1Q66JQ7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Knl1Q66JQ7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Knl1Q66JQ7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Knl1Q66JQ7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Knl1Q66JQ7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Knl1Q66JQ7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Knl1Q66JQ7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Knl1Q66JQ7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Knl1Q66JQ7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Knl1Q66JQ7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Knl1Q66JQ7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Knl1Q66JQ7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Knl1Q66JQ7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Knl1Q66JQ7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Knl1Q66JQ7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Knl1Q66JQ7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Knl1Q66JQ7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Knl1Q66JQ7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Knl1Q66JQ7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Knl1Q66JQ7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Knl1Q66JQ7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Knl1Q66JQ7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Knl1Q66JQ7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Knl1Q66JQ7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Knl1Q66JQ7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Knl1Q66JQ7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Knl1Q66JQ7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Knl1Q66JQ7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Knl1Q66JQ7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Knl1Q66JQ7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Knl1Q66JQ7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Knl1Q66JQ7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Knl1Q66JQ7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Knl1Q66JQ7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Knl1Q66JQ7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Knl1Q66JQ7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Knl1Q66JQ7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Knl1Q66JQ7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Knl1Q66JQ7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Knl1Q66JQ7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Knl1Q66JQ7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Knl1Q66JQ7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Knl1Q66JQ7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Knl1Q66JQ7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Knl1Q66JQ7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Knl1Q66JQ7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Knl1Q66JQ7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Knl1Q66JQ7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Knl1Q66JQ7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Knl1Q66JQ7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
Knl1Q66JQ7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Knl1Q66JQ7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Knl1Q66JQ7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Knl1Q66JQ7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Knl1Q66JQ7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Knl1Q66JQ7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Knl1Q66JQ7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Knl1Q66JQ7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Knl1Q66JQ7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Knl1Q66JQ7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Knl1Q66JQ7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Knl1Q66JQ7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Knl1Q66JQ7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Knl1Q66JQ7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Knl1Q66JQ7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Knl1Q66JQ7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms