Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VclQ64727 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VclQ64727 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VclQ64727 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VclQ64727 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VclQ64727 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VclQ64727 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VclQ64727 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VclQ64727 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VclQ64727 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VclQ64727 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VclQ64727 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VclQ64727 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VclQ64727 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VclQ64727 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VclQ64727 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VclQ64727 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VclQ64727 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VclQ64727 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VclQ64727 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VclQ64727 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VclQ64727 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VclQ64727 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VclQ64727 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VclQ64727 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VclQ64727 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VclQ64727 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VclQ64727 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VclQ64727 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VclQ64727 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VclQ64727 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VclQ64727 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VclQ64727 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VclQ64727 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VclQ64727 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VclQ64727 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VclQ64727 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VclQ64727 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VclQ64727 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VclQ64727 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VclQ64727 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VclQ64727 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VclQ64727 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VclQ64727 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VclQ64727 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VclQ64727 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VclQ64727 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VclQ64727 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VclQ64727 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VclQ64727 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VclQ64727 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VclQ64727 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VclQ64727 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VclQ64727 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VclQ64727 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VclQ64727 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VclQ64727 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VclQ64727 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VclQ64727 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VclQ64727 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VclQ64727 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VclQ64727 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VclQ64727 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VclQ64727 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VclQ64727 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VclQ64727 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VclQ64727 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VclQ64727 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VclQ64727 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VclQ64727 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VclQ64727 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VclQ64727 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VclQ64727 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VclQ64727 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VclQ64727 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VclQ64727 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VclQ64727 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VclQ64727 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VclQ64727 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VclQ64727 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VclQ64727 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VclQ64727 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VclQ64727 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VclQ64727 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VclQ64727 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VclQ64727 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VclQ64727 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VclQ64727 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VclQ64727 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VclQ64727 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VclQ64727 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VclQ64727 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VclQ64727 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VclQ64727 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VclQ64727 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VclQ64727 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VclQ64727 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VclQ64727 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VclQ64727 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VclQ64727 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms