Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprdQ64487 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PtprdQ64487 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprdQ64487 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprdQ64487 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprdQ64487 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprdQ64487 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprdQ64487 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprdQ64487 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprdQ64487 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprdQ64487 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprdQ64487 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprdQ64487 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprdQ64487 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprdQ64487 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprdQ64487 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprdQ64487 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprdQ64487 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprdQ64487 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprdQ64487 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprdQ64487 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprdQ64487 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprdQ64487 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprdQ64487 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprdQ64487 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprdQ64487 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprdQ64487 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprdQ64487 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprdQ64487 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtprdQ64487 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PtprdQ64487 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprdQ64487 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprdQ64487 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprdQ64487 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprdQ64487 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprdQ64487 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprdQ64487 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprdQ64487 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprdQ64487 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprdQ64487 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprdQ64487 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprdQ64487 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprdQ64487 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprdQ64487 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprdQ64487 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprdQ64487 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprdQ64487 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprdQ64487 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprdQ64487 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprdQ64487 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprdQ64487 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprdQ64487 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprdQ64487 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprdQ64487 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprdQ64487 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprdQ64487 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprdQ64487 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprdQ64487 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprdQ64487 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprdQ64487 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprdQ64487 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprdQ64487 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprdQ64487 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprdQ64487 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprdQ64487 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprdQ64487 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprdQ64487 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprdQ64487 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprdQ64487 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprdQ64487 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprdQ64487 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprdQ64487 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprdQ64487 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprdQ64487 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprdQ64487 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprdQ64487 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprdQ64487 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprdQ64487 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprdQ64487 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprdQ64487 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprdQ64487 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprdQ64487 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprdQ64487 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprdQ64487 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprdQ64487 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprdQ64487 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprdQ64487 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprdQ64487 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprdQ64487 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprdQ64487 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprdQ64487 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprdQ64487 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprdQ64487 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprdQ64487 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms