Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PatjQ63ZW7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PatjQ63ZW7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PatjQ63ZW7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PatjQ63ZW7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PatjQ63ZW7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PatjQ63ZW7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PatjQ63ZW7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PatjQ63ZW7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PatjQ63ZW7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PatjQ63ZW7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PatjQ63ZW7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PatjQ63ZW7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PatjQ63ZW7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PatjQ63ZW7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PatjQ63ZW7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PatjQ63ZW7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PatjQ63ZW7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PatjQ63ZW7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PatjQ63ZW7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PatjQ63ZW7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PatjQ63ZW7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PatjQ63ZW7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PatjQ63ZW7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PatjQ63ZW7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PatjQ63ZW7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PatjQ63ZW7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PatjQ63ZW7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PatjQ63ZW7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PatjQ63ZW7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PatjQ63ZW7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PatjQ63ZW7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PatjQ63ZW7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PatjQ63ZW7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PatjQ63ZW7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PatjQ63ZW7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PatjQ63ZW7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PatjQ63ZW7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PatjQ63ZW7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PatjQ63ZW7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PatjQ63ZW7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PatjQ63ZW7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PatjQ63ZW7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PatjQ63ZW7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PatjQ63ZW7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PatjQ63ZW7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PatjQ63ZW7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PatjQ63ZW7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PatjQ63ZW7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PatjQ63ZW7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PatjQ63ZW7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PatjQ63ZW7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PatjQ63ZW7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PatjQ63ZW7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PatjQ63ZW7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PatjQ63ZW7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PatjQ63ZW7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PatjQ63ZW7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PatjQ63ZW7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PatjQ63ZW7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PatjQ63ZW7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PatjQ63ZW7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PatjQ63ZW7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PatjQ63ZW7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PatjQ63ZW7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PatjQ63ZW7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PatjQ63ZW7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PatjQ63ZW7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PatjQ63ZW7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PatjQ63ZW7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PatjQ63ZW7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PatjQ63ZW7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PatjQ63ZW7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PatjQ63ZW7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PatjQ63ZW7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PatjQ63ZW7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PatjQ63ZW7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PatjQ63ZW7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PatjQ63ZW7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PatjQ63ZW7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PatjQ63ZW7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PatjQ63ZW7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PatjQ63ZW7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PatjQ63ZW7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PatjQ63ZW7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PatjQ63ZW7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PatjQ63ZW7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PatjQ63ZW7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PatjQ63ZW7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PatjQ63ZW7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PatjQ63ZW7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PatjQ63ZW7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PatjQ63ZW7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PatjQ63ZW7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PatjQ63ZW7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PatjQ63ZW7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PatjQ63ZW7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PatjQ63ZW7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PatjQ63ZW7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PatjQ63ZW7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms