Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Col4a5Q63ZW6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Col4a5Q63ZW6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Col4a5Q63ZW6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Col4a5Q63ZW6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Col4a5Q63ZW6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Col4a5Q63ZW6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Col4a5Q63ZW6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Col4a5Q63ZW6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col4a5Q63ZW6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col4a5Q63ZW6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col4a5Q63ZW6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Col4a5Q63ZW6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Col4a5Q63ZW6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Col4a5Q63ZW6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Col4a5Q63ZW6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Col4a5Q63ZW6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Col4a5Q63ZW6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Col4a5Q63ZW6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Col4a5Q63ZW6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Col4a5Q63ZW6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Col4a5Q63ZW6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Col4a5Q63ZW6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Col4a5Q63ZW6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Col4a5Q63ZW6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Col4a5Q63ZW6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Col4a5Q63ZW6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Col4a5Q63ZW6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Col4a5Q63ZW6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Col4a5Q63ZW6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Col4a5Q63ZW6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Col4a5Q63ZW6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Col4a5Q63ZW6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Col4a5Q63ZW6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Col4a5Q63ZW6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Col4a5Q63ZW6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Col4a5Q63ZW6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Col4a5Q63ZW6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Col4a5Q63ZW6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Col4a5Q63ZW6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Col4a5Q63ZW6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Col4a5Q63ZW6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Col4a5Q63ZW6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Col4a5Q63ZW6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Col4a5Q63ZW6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Col4a5Q63ZW6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Col4a5Q63ZW6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Col4a5Q63ZW6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Col4a5Q63ZW6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Col4a5Q63ZW6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Col4a5Q63ZW6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Col4a5Q63ZW6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Col4a5Q63ZW6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Col4a5Q63ZW6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Col4a5Q63ZW6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Col4a5Q63ZW6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Col4a5Q63ZW6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Col4a5Q63ZW6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Col4a5Q63ZW6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Col4a5Q63ZW6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Col4a5Q63ZW6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Col4a5Q63ZW6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Col4a5Q63ZW6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Col4a5Q63ZW6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Col4a5Q63ZW6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Col4a5Q63ZW6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Col4a5Q63ZW6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Col4a5Q63ZW6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Col4a5Q63ZW6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Col4a5Q63ZW6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Col4a5Q63ZW6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Col4a5Q63ZW6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Col4a5Q63ZW6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Col4a5Q63ZW6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Col4a5Q63ZW6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Col4a5Q63ZW6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Col4a5Q63ZW6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Col4a5Q63ZW6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Col4a5Q63ZW6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Col4a5Q63ZW6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Col4a5Q63ZW6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Col4a5Q63ZW6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Col4a5Q63ZW6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Col4a5Q63ZW6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Col4a5Q63ZW6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Col4a5Q63ZW6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Col4a5Q63ZW6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Col4a5Q63ZW6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Col4a5Q63ZW6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Col4a5Q63ZW6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Col4a5Q63ZW6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Col4a5Q63ZW6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Col4a5Q63ZW6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Col4a5Q63ZW6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Col4a5Q63ZW6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Col4a5Q63ZW6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Col4a5Q63ZW6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Col4a5Q63ZW6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Col4a5Q63ZW6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms