Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nptx1Q62443 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nptx1Q62443 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nptx1Q62443 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nptx1Q62443 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nptx1Q62443 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nptx1Q62443 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nptx1Q62443 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nptx1Q62443 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nptx1Q62443 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nptx1Q62443 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nptx1Q62443 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nptx1Q62443 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nptx1Q62443 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nptx1Q62443 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nptx1Q62443 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nptx1Q62443 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nptx1Q62443 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nptx1Q62443 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nptx1Q62443 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nptx1Q62443 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nptx1Q62443 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nptx1Q62443 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nptx1Q62443 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nptx1Q62443 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nptx1Q62443 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nptx1Q62443 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nptx1Q62443 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nptx1Q62443 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nptx1Q62443 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nptx1Q62443 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nptx1Q62443 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nptx1Q62443 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nptx1Q62443 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nptx1Q62443 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nptx1Q62443 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nptx1Q62443 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nptx1Q62443 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nptx1Q62443 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nptx1Q62443 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nptx1Q62443 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nptx1Q62443 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nptx1Q62443 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nptx1Q62443 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nptx1Q62443 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nptx1Q62443 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nptx1Q62443 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nptx1Q62443 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nptx1Q62443 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nptx1Q62443 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nptx1Q62443 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nptx1Q62443 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nptx1Q62443 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nptx1Q62443 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nptx1Q62443 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nptx1Q62443 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nptx1Q62443 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nptx1Q62443 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nptx1Q62443 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nptx1Q62443 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nptx1Q62443 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nptx1Q62443 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nptx1Q62443 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nptx1Q62443 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nptx1Q62443 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nptx1Q62443 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nptx1Q62443 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nptx1Q62443 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nptx1Q62443 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nptx1Q62443 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nptx1Q62443 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nptx1Q62443 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nptx1Q62443 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nptx1Q62443 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nptx1Q62443 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nptx1Q62443 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nptx1Q62443 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nptx1Q62443 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nptx1Q62443 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nptx1Q62443 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nptx1Q62443 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nptx1Q62443 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nptx1Q62443 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nptx1Q62443 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nptx1Q62443 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nptx1Q62443 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nptx1Q62443 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nptx1Q62443 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nptx1Q62443 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nptx1Q62443 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nptx1Q62443 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nptx1Q62443 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nptx1Q62443 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nptx1Q62443 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nptx1Q62443 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nptx1Q62443 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nptx1Q62443 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nptx1Q62443 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nptx1Q62443 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nptx1Q62443 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 326.4 ms