Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ssr4Q62186 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ssr4Q62186 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ssr4Q62186 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ssr4Q62186 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ssr4Q62186 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ssr4Q62186 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ssr4Q62186 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ssr4Q62186 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ssr4Q62186 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ssr4Q62186 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ssr4Q62186 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ssr4Q62186 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ssr4Q62186 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ssr4Q62186 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ssr4Q62186 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ssr4Q62186 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ssr4Q62186 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ssr4Q62186 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ssr4Q62186 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssr4Q62186 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ssr4Q62186 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ssr4Q62186 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ssr4Q62186 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ssr4Q62186 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ssr4Q62186 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssr4Q62186 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssr4Q62186 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssr4Q62186 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssr4Q62186 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssr4Q62186 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssr4Q62186 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssr4Q62186 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssr4Q62186 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssr4Q62186 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssr4Q62186 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssr4Q62186 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssr4Q62186 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ssr4Q62186 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ssr4Q62186 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ssr4Q62186 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ssr4Q62186 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ssr4Q62186 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ssr4Q62186 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ssr4Q62186 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ssr4Q62186 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ssr4Q62186 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ssr4Q62186 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ssr4Q62186 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ssr4Q62186 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ssr4Q62186 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ssr4Q62186 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ssr4Q62186 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ssr4Q62186 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ssr4Q62186 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssr4Q62186 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssr4Q62186 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssr4Q62186 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ssr4Q62186 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssr4Q62186 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssr4Q62186 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssr4Q62186 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssr4Q62186 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssr4Q62186 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssr4Q62186 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssr4Q62186 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssr4Q62186 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssr4Q62186 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssr4Q62186 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssr4Q62186 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssr4Q62186 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssr4Q62186 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssr4Q62186 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssr4Q62186 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssr4Q62186 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssr4Q62186 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssr4Q62186 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ssr4Q62186 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ssr4Q62186 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ssr4Q62186 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ssr4Q62186 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssr4Q62186 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssr4Q62186 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssr4Q62186 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ssr4Q62186 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ssr4Q62186 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ssr4Q62186 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssr4Q62186 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssr4Q62186 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssr4Q62186 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ssr4Q62186 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssr4Q62186 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssr4Q62186 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssr4Q62186 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssr4Q62186 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssr4Q62186 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssr4Q62186 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssr4Q62186 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssr4Q62186 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssr4Q62186 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms