Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkciQ62074 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkciQ62074 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkciQ62074 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkciQ62074 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkciQ62074 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkciQ62074 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkciQ62074 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkciQ62074 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkciQ62074 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkciQ62074 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkciQ62074 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkciQ62074 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkciQ62074 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PrkciQ62074 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkciQ62074 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkciQ62074 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkciQ62074 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkciQ62074 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkciQ62074 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkciQ62074 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkciQ62074 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkciQ62074 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkciQ62074 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkciQ62074 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkciQ62074 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkciQ62074 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkciQ62074 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkciQ62074 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkciQ62074 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkciQ62074 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkciQ62074 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkciQ62074 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkciQ62074 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkciQ62074 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkciQ62074 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkciQ62074 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkciQ62074 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkciQ62074 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PrkciQ62074 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PrkciQ62074 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkciQ62074 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkciQ62074 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkciQ62074 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkciQ62074 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkciQ62074 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkciQ62074 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkciQ62074 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkciQ62074 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkciQ62074 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkciQ62074 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkciQ62074 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkciQ62074 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkciQ62074 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkciQ62074 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkciQ62074 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkciQ62074 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkciQ62074 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkciQ62074 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkciQ62074 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkciQ62074 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkciQ62074 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkciQ62074 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkciQ62074 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PrkciQ62074 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PrkciQ62074 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkciQ62074 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkciQ62074 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkciQ62074 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkciQ62074 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkciQ62074 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkciQ62074 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkciQ62074 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkciQ62074 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkciQ62074 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkciQ62074 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkciQ62074 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkciQ62074 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkciQ62074 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkciQ62074 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkciQ62074 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkciQ62074 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkciQ62074 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkciQ62074 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkciQ62074 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkciQ62074 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkciQ62074 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkciQ62074 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkciQ62074 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkciQ62074 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkciQ62074 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkciQ62074 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkciQ62074 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkciQ62074 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkciQ62074 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkciQ62074 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkciQ62074 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkciQ62074 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkciQ62074 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkciQ62074 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms