Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ctr9Q62018 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ctr9Q62018 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ctr9Q62018 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ctr9Q62018 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ctr9Q62018 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ctr9Q62018 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ctr9Q62018 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ctr9Q62018 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ctr9Q62018 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ctr9Q62018 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ctr9Q62018 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ctr9Q62018 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ctr9Q62018 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ctr9Q62018 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ctr9Q62018 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ctr9Q62018 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ctr9Q62018 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ctr9Q62018 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ctr9Q62018 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ctr9Q62018 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ctr9Q62018 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ctr9Q62018 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ctr9Q62018 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ctr9Q62018 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ctr9Q62018 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ctr9Q62018 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ctr9Q62018 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ctr9Q62018 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ctr9Q62018 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ctr9Q62018 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ctr9Q62018 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ctr9Q62018 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ctr9Q62018 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ctr9Q62018 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ctr9Q62018 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ctr9Q62018 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ctr9Q62018 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ctr9Q62018 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ctr9Q62018 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ctr9Q62018 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ctr9Q62018 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ctr9Q62018 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ctr9Q62018 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ctr9Q62018 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ctr9Q62018 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ctr9Q62018 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ctr9Q62018 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ctr9Q62018 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ctr9Q62018 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ctr9Q62018 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ctr9Q62018 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ctr9Q62018 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ctr9Q62018 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ctr9Q62018 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ctr9Q62018 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ctr9Q62018 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Ctr9Q62018 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ctr9Q62018 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ctr9Q62018 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ctr9Q62018 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ctr9Q62018 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ctr9Q62018 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ctr9Q62018 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ctr9Q62018 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ctr9Q62018 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ctr9Q62018 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ctr9Q62018 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ctr9Q62018 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ctr9Q62018 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ctr9Q62018 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ctr9Q62018 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ctr9Q62018 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ctr9Q62018 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ctr9Q62018 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ctr9Q62018 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ctr9Q62018 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ctr9Q62018 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ctr9Q62018 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ctr9Q62018 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ctr9Q62018 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ctr9Q62018 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ctr9Q62018 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ctr9Q62018 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ctr9Q62018 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ctr9Q62018 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ctr9Q62018 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ctr9Q62018 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ctr9Q62018 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ctr9Q62018 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ctr9Q62018 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ctr9Q62018 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ctr9Q62018 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ctr9Q62018 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ctr9Q62018 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ctr9Q62018 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ctr9Q62018 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ctr9Q62018 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ctr9Q62018 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ctr9Q62018 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.4 ms