Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Odf1Q61999 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Odf1Q61999 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Odf1Q61999 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Odf1Q61999 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Odf1Q61999 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms