Protein–RNA interactions for Protein: Q61550

Rad21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad21Q61550 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rad21Q61550 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Rad21Q61550 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rad21Q61550 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rad21Q61550 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rad21Q61550 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Rad21Q61550 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rad21Q61550 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rad21Q61550 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rad21Q61550 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rad21Q61550 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rad21Q61550 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rad21Q61550 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rad21Q61550 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rad21Q61550 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rad21Q61550 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rad21Q61550 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rad21Q61550 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rad21Q61550 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rad21Q61550 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rad21Q61550 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rad21Q61550 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rad21Q61550 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rad21Q61550 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Rad21Q61550 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Rad21Q61550 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rad21Q61550 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rad21Q61550 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rad21Q61550 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rad21Q61550 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rad21Q61550 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rad21Q61550 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rad21Q61550 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rad21Q61550 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rad21Q61550 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rad21Q61550 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Rad21Q61550 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rad21Q61550 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rad21Q61550 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rad21Q61550 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rad21Q61550 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rad21Q61550 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rad21Q61550 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rad21Q61550 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rad21Q61550 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Rad21Q61550 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Rad21Q61550 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rad21Q61550 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rad21Q61550 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rad21Q61550 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rad21Q61550 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rad21Q61550 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rad21Q61550 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rad21Q61550 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rad21Q61550 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rad21Q61550 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rad21Q61550 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rad21Q61550 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rad21Q61550 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rad21Q61550 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rad21Q61550 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rad21Q61550 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rad21Q61550 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rad21Q61550 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rad21Q61550 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rad21Q61550 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rad21Q61550 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rad21Q61550 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rad21Q61550 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rad21Q61550 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rad21Q61550 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rad21Q61550 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rad21Q61550 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Rad21Q61550 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rad21Q61550 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rad21Q61550 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rad21Q61550 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rad21Q61550 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rad21Q61550 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rad21Q61550 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rad21Q61550 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rad21Q61550 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rad21Q61550 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rad21Q61550 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rad21Q61550 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rad21Q61550 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rad21Q61550 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rad21Q61550 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rad21Q61550 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rad21Q61550 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rad21Q61550 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rad21Q61550 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rad21Q61550 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rad21Q61550 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Rad21Q61550 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rad21Q61550 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rad21Q61550 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rad21Q61550 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rad21Q61550 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rad21Q61550 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms