Protein–RNA interactions for Protein: Q61549

Adgre1, Adhesion G protein-coupled receptor E1, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Adgre1Q61549 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Adgre1Q61549 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Adgre1Q61549 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Adgre1Q61549 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Adgre1Q61549 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Adgre1Q61549 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Adgre1Q61549 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Adgre1Q61549 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Adgre1Q61549 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Adgre1Q61549 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Adgre1Q61549 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Adgre1Q61549 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Adgre1Q61549 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Adgre1Q61549 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Adgre1Q61549 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Adgre1Q61549 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Adgre1Q61549 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Adgre1Q61549 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Adgre1Q61549 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Adgre1Q61549 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Adgre1Q61549 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Adgre1Q61549 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Adgre1Q61549 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Adgre1Q61549 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Adgre1Q61549 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Adgre1Q61549 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Adgre1Q61549 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Adgre1Q61549 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Adgre1Q61549 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Adgre1Q61549 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Adgre1Q61549 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Adgre1Q61549 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Adgre1Q61549 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Adgre1Q61549 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Adgre1Q61549 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Adgre1Q61549 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Adgre1Q61549 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Adgre1Q61549 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Adgre1Q61549 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Adgre1Q61549 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Adgre1Q61549 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Adgre1Q61549 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Adgre1Q61549 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Adgre1Q61549 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Adgre1Q61549 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Adgre1Q61549 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Adgre1Q61549 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Adgre1Q61549 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Adgre1Q61549 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Adgre1Q61549 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Adgre1Q61549 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Adgre1Q61549 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Adgre1Q61549 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Adgre1Q61549 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Adgre1Q61549 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Adgre1Q61549 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Adgre1Q61549 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Adgre1Q61549 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Adgre1Q61549 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Adgre1Q61549 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Adgre1Q61549 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Adgre1Q61549 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Adgre1Q61549 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Adgre1Q61549 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Adgre1Q61549 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Adgre1Q61549 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Adgre1Q61549 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Adgre1Q61549 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Adgre1Q61549 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Adgre1Q61549 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Adgre1Q61549 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Adgre1Q61549 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Adgre1Q61549 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Adgre1Q61549 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Adgre1Q61549 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Adgre1Q61549 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Adgre1Q61549 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Adgre1Q61549 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Adgre1Q61549 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Adgre1Q61549 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Adgre1Q61549 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Adgre1Q61549 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Adgre1Q61549 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Adgre1Q61549 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Adgre1Q61549 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Adgre1Q61549 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Adgre1Q61549 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Adgre1Q61549 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Adgre1Q61549 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Adgre1Q61549 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Adgre1Q61549 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Adgre1Q61549 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Adgre1Q61549 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Adgre1Q61549 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Adgre1Q61549 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Adgre1Q61549 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Adgre1Q61549 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Adgre1Q61549 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Adgre1Q61549 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Adgre1Q61549 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms