Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mre11Q61216 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mre11Q61216 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mre11Q61216 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Mre11Q61216 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mre11Q61216 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mre11Q61216 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mre11Q61216 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mre11Q61216 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mre11Q61216 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mre11Q61216 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mre11Q61216 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mre11Q61216 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mre11Q61216 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mre11Q61216 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Mre11Q61216 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Mre11Q61216 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Mre11Q61216 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mre11Q61216 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mre11Q61216 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mre11Q61216 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mre11Q61216 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mre11Q61216 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mre11Q61216 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mre11Q61216 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mre11Q61216 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mre11Q61216 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mre11Q61216 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mre11Q61216 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mre11Q61216 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mre11Q61216 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mre11Q61216 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Mre11Q61216 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mre11Q61216 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mre11Q61216 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Mre11Q61216 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Mre11Q61216 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Mre11Q61216 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Mre11Q61216 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mre11Q61216 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mre11Q61216 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mre11Q61216 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mre11Q61216 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Mre11Q61216 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Mre11Q61216 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mre11Q61216 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mre11Q61216 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Mre11Q61216 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Mre11Q61216 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mre11Q61216 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mre11Q61216 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mre11Q61216 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Mre11Q61216 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mre11Q61216 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mre11Q61216 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mre11Q61216 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mre11Q61216 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mre11Q61216 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mre11Q61216 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mre11Q61216 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mre11Q61216 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mre11Q61216 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mre11Q61216 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mre11Q61216 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mre11Q61216 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mre11Q61216 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mre11Q61216 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mre11Q61216 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mre11Q61216 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Mre11Q61216 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mre11Q61216 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mre11Q61216 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mre11Q61216 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mre11Q61216 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mre11Q61216 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mre11Q61216 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mre11Q61216 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mre11Q61216 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mre11Q61216 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mre11Q61216 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mre11Q61216 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mre11Q61216 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mre11Q61216 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mre11Q61216 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mre11Q61216 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mre11Q61216 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mre11Q61216 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mre11Q61216 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mre11Q61216 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Mre11Q61216 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mre11Q61216 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mre11Q61216 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mre11Q61216 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mre11Q61216 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mre11Q61216 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mre11Q61216 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mre11Q61216 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Mre11Q61216 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Mre11Q61216 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Mre11Q61216 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms