Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp4Q60972 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp4Q60972 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp4Q60972 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp4Q60972 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp4Q60972 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp4Q60972 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp4Q60972 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbbp4Q60972 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbbp4Q60972 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp4Q60972 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp4Q60972 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp4Q60972 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp4Q60972 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp4Q60972 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbbp4Q60972 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbbp4Q60972 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbbp4Q60972 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbbp4Q60972 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbbp4Q60972 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbbp4Q60972 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp4Q60972 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbbp4Q60972 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp4Q60972 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbbp4Q60972 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp4Q60972 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp4Q60972 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp4Q60972 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp4Q60972 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp4Q60972 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp4Q60972 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbbp4Q60972 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbbp4Q60972 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbbp4Q60972 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbbp4Q60972 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbbp4Q60972 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbbp4Q60972 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbbp4Q60972 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbbp4Q60972 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbbp4Q60972 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp4Q60972 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp4Q60972 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp4Q60972 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbbp4Q60972 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbbp4Q60972 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rbbp4Q60972 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rbbp4Q60972 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp4Q60972 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp4Q60972 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp4Q60972 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp4Q60972 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp4Q60972 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp4Q60972 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp4Q60972 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp4Q60972 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp4Q60972 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp4Q60972 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp4Q60972 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp4Q60972 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp4Q60972 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp4Q60972 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp4Q60972 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp4Q60972 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp4Q60972 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp4Q60972 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp4Q60972 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp4Q60972 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms