Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kpna1Q60960 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kpna1Q60960 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kpna1Q60960 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kpna1Q60960 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kpna1Q60960 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kpna1Q60960 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kpna1Q60960 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kpna1Q60960 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kpna1Q60960 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kpna1Q60960 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kpna1Q60960 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Kpna1Q60960 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kpna1Q60960 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kpna1Q60960 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kpna1Q60960 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kpna1Q60960 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kpna1Q60960 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kpna1Q60960 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kpna1Q60960 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kpna1Q60960 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kpna1Q60960 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kpna1Q60960 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kpna1Q60960 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kpna1Q60960 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kpna1Q60960 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kpna1Q60960 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Kpna1Q60960 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Kpna1Q60960 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kpna1Q60960 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kpna1Q60960 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kpna1Q60960 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kpna1Q60960 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kpna1Q60960 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kpna1Q60960 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kpna1Q60960 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kpna1Q60960 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kpna1Q60960 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kpna1Q60960 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kpna1Q60960 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kpna1Q60960 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kpna1Q60960 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kpna1Q60960 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kpna1Q60960 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kpna1Q60960 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kpna1Q60960 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kpna1Q60960 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kpna1Q60960 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kpna1Q60960 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kpna1Q60960 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kpna1Q60960 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kpna1Q60960 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kpna1Q60960 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kpna1Q60960 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kpna1Q60960 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kpna1Q60960 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kpna1Q60960 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kpna1Q60960 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kpna1Q60960 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kpna1Q60960 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kpna1Q60960 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kpna1Q60960 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kpna1Q60960 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kpna1Q60960 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kpna1Q60960 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kpna1Q60960 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kpna1Q60960 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Kpna1Q60960 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Kpna1Q60960 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Kpna1Q60960 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kpna1Q60960 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kpna1Q60960 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Kpna1Q60960 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kpna1Q60960 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kpna1Q60960 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kpna1Q60960 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kpna1Q60960 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kpna1Q60960 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Kpna1Q60960 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Kpna1Q60960 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kpna1Q60960 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kpna1Q60960 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kpna1Q60960 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kpna1Q60960 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kpna1Q60960 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kpna1Q60960 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kpna1Q60960 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kpna1Q60960 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kpna1Q60960 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kpna1Q60960 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kpna1Q60960 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kpna1Q60960 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Kpna1Q60960 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kpna1Q60960 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kpna1Q60960 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kpna1Q60960 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kpna1Q60960 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kpna1Q60960 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kpna1Q60960 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kpna1Q60960 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms