Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppp1r1bQ60829 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppp1r1bQ60829 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ppp1r1bQ60829 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ppp1r1bQ60829 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ppp1r1bQ60829 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ppp1r1bQ60829 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ppp1r1bQ60829 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ppp1r1bQ60829 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ppp1r1bQ60829 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ppp1r1bQ60829 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ppp1r1bQ60829 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ppp1r1bQ60829 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ppp1r1bQ60829 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ppp1r1bQ60829 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ppp1r1bQ60829 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ppp1r1bQ60829 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ppp1r1bQ60829 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppp1r1bQ60829 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppp1r1bQ60829 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppp1r1bQ60829 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ppp1r1bQ60829 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ppp1r1bQ60829 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ppp1r1bQ60829 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ppp1r1bQ60829 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ppp1r1bQ60829 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ppp1r1bQ60829 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ppp1r1bQ60829 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ppp1r1bQ60829 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ppp1r1bQ60829 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ppp1r1bQ60829 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppp1r1bQ60829 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppp1r1bQ60829 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppp1r1bQ60829 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppp1r1bQ60829 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ppp1r1bQ60829 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ppp1r1bQ60829 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ppp1r1bQ60829 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ppp1r1bQ60829 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ppp1r1bQ60829 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ppp1r1bQ60829 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ppp1r1bQ60829 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ppp1r1bQ60829 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ppp1r1bQ60829 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ppp1r1bQ60829 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ppp1r1bQ60829 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ppp1r1bQ60829 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ppp1r1bQ60829 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ppp1r1bQ60829 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ppp1r1bQ60829 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ppp1r1bQ60829 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ppp1r1bQ60829 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ppp1r1bQ60829 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ppp1r1bQ60829 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ppp1r1bQ60829 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ppp1r1bQ60829 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ppp1r1bQ60829 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppp1r1bQ60829 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppp1r1bQ60829 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppp1r1bQ60829 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppp1r1bQ60829 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppp1r1bQ60829 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppp1r1bQ60829 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppp1r1bQ60829 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppp1r1bQ60829 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ppp1r1bQ60829 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ppp1r1bQ60829 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ppp1r1bQ60829 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Ppp1r1bQ60829 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ppp1r1bQ60829 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ppp1r1bQ60829 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ppp1r1bQ60829 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ppp1r1bQ60829 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ppp1r1bQ60829 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ppp1r1bQ60829 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ppp1r1bQ60829 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ppp1r1bQ60829 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ppp1r1bQ60829 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppp1r1bQ60829 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppp1r1bQ60829 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppp1r1bQ60829 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppp1r1bQ60829 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ppp1r1bQ60829 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ppp1r1bQ60829 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ppp1r1bQ60829 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ppp1r1bQ60829 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppp1r1bQ60829 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppp1r1bQ60829 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ppp1r1bQ60829 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ppp1r1bQ60829 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppp1r1bQ60829 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppp1r1bQ60829 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppp1r1bQ60829 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppp1r1bQ60829 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppp1r1bQ60829 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppp1r1bQ60829 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppp1r1bQ60829 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppp1r1bQ60829 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppp1r1bQ60829 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppp1r1bQ60829 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms