Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkn2cQ60772 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkn2cQ60772 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkn2cQ60772 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdkn2cQ60772 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdkn2cQ60772 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cdkn2cQ60772 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkn2cQ60772 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdkn2cQ60772 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdkn2cQ60772 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdkn2cQ60772 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdkn2cQ60772 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdkn2cQ60772 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdkn2cQ60772 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdkn2cQ60772 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdkn2cQ60772 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdkn2cQ60772 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdkn2cQ60772 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdkn2cQ60772 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdkn2cQ60772 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdkn2cQ60772 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdkn2cQ60772 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdkn2cQ60772 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdkn2cQ60772 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdkn2cQ60772 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdkn2cQ60772 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdkn2cQ60772 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdkn2cQ60772 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdkn2cQ60772 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdkn2cQ60772 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdkn2cQ60772 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdkn2cQ60772 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdkn2cQ60772 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdkn2cQ60772 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdkn2cQ60772 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkn2cQ60772 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkn2cQ60772 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkn2cQ60772 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkn2cQ60772 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkn2cQ60772 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkn2cQ60772 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkn2cQ60772 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkn2cQ60772 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkn2cQ60772 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkn2cQ60772 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkn2cQ60772 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkn2cQ60772 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkn2cQ60772 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkn2cQ60772 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkn2cQ60772 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkn2cQ60772 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkn2cQ60772 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkn2cQ60772 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkn2cQ60772 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkn2cQ60772 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdkn2cQ60772 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdkn2cQ60772 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdkn2cQ60772 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdkn2cQ60772 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdkn2cQ60772 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkn2cQ60772 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkn2cQ60772 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkn2cQ60772 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdkn2cQ60772 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdkn2cQ60772 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdkn2cQ60772 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdkn2cQ60772 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms