Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Mkrn3Q60764 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mkrn3Q60764 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mkrn3Q60764 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mkrn3Q60764 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Mkrn3Q60764 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Mkrn3Q60764 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mkrn3Q60764 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mkrn3Q60764 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Mkrn3Q60764 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mkrn3Q60764 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mkrn3Q60764 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Mkrn3Q60764 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mkrn3Q60764 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mkrn3Q60764 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Mkrn3Q60764 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Mkrn3Q60764 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mkrn3Q60764 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Mkrn3Q60764 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mkrn3Q60764 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mkrn3Q60764 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Mkrn3Q60764 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mkrn3Q60764 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mkrn3Q60764 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mkrn3Q60764 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mkrn3Q60764 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mkrn3Q60764 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mkrn3Q60764 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Mkrn3Q60764 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mkrn3Q60764 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mkrn3Q60764 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mkrn3Q60764 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mkrn3Q60764 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mkrn3Q60764 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mkrn3Q60764 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mkrn3Q60764 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mkrn3Q60764 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Mkrn3Q60764 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Mkrn3Q60764 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Mkrn3Q60764 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mkrn3Q60764 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mkrn3Q60764 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mkrn3Q60764 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mkrn3Q60764 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mkrn3Q60764 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Mkrn3Q60764 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mkrn3Q60764 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mkrn3Q60764 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mkrn3Q60764 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Mkrn3Q60764 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mkrn3Q60764 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mkrn3Q60764 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mkrn3Q60764 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mkrn3Q60764 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mkrn3Q60764 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mkrn3Q60764 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mkrn3Q60764 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Mkrn3Q60764 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mkrn3Q60764 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mkrn3Q60764 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mkrn3Q60764 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mkrn3Q60764 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mkrn3Q60764 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mkrn3Q60764 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Mkrn3Q60764 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mkrn3Q60764 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mkrn3Q60764 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mkrn3Q60764 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mkrn3Q60764 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mkrn3Q60764 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mkrn3Q60764 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mkrn3Q60764 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mkrn3Q60764 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mkrn3Q60764 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mkrn3Q60764 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mkrn3Q60764 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mkrn3Q60764 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mkrn3Q60764 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mkrn3Q60764 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Mkrn3Q60764 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mkrn3Q60764 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mkrn3Q60764 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mkrn3Q60764 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mkrn3Q60764 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mkrn3Q60764 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mkrn3Q60764 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mkrn3Q60764 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mkrn3Q60764 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mkrn3Q60764 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mkrn3Q60764 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mkrn3Q60764 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mkrn3Q60764 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mkrn3Q60764 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mkrn3Q60764 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Mkrn3Q60764 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mkrn3Q60764 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mkrn3Q60764 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mkrn3Q60764 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mkrn3Q60764 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mkrn3Q60764 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms